通过mongolite从R向MongoDB添加列会导致持续错误

Question

我想通过R向MongoDB集合添加一个列，该集合具有表格格式，并且已经相对较大(14000000项，140个列)。

我目前使用的函数是

function (collection, name, value) 
{
    mongolite::mongo(collection)$update("{}", paste0("{\"$set\":{\"", 
        name, "\": ", value, "}}"), multiple = TRUE)

    invisible(NULL)
}

到目前为止确实有效。(大约需要5-10分钟，没问题。不过，如果速度能有所提高，那就太好了)。

然而，它也给了我持久的以下错误，它中断了脚本其余部分的执行。

错误消息如下：

错误:未能发送带有数据库“test”的"update“命令:无法读取4个字节:套接字错误或超时

如能帮助解决此错误，将不胜感激。(如果有办法提高更新本身的性能，我也非常乐意听取任何建议。)

Answer 1

默认的套接字超时时间是5分钟。

可以通过直接在连接URI中设置sockettimeoutms来覆盖默认设置：

mongoURI <-  paste0("mongodb://", user,":",pass, "@", mongoHost, ":", mongoPort,"/",db,"?sockettimeoutms=<something large enough in milliseconds>")

mcon <- mongo(mongoCollection, url=mongoURI)

mcon$update(...)