在python中使用.tiff映像进行深度学习

Question

我目前正在使用python中的成像流式细胞术图像进行一个项目。图像为.tiff，示例文件名为image27_Ch1.ome.tiff。我在打开这些图片时遇到了一点小麻烦。我尝试过使用matplotlib和PIL以及tifffile库，但是我尝试的任何东西似乎都不起作用。它总是告诉我没有这样的文件或目录：'C:/Users/zacha/Desktop/cell_images/27_Ch1.ome.tiff‘：FileNotFoundError: Errno 2。尽管我双倍并三次检查到图像的目录是否正确，但即使我从图像属性本身复制并粘贴到图像的路径时，它仍然会给我这个错误。我尝试将一些图像转换为.png图像，代码可以工作，并将加载图像，这并不理想，因为我有几十万张图像的数据集。我想知道在StackOverflow世界中是否有人知道如何处理这样的问题，或者在过去曾经处理过python中的.tiff图像。下面是我试图打开这些图像的一些代码。

import matplotlib.pyplot as plt
path = 'C:/Users/zacha/Desktop/cell_images/27_Ch1.ome.tiff'
I = plt.imread(path)


from PIL import Image
path = 'C:/Users/zacha/Desktop/cell_images/27_Ch1.ome.tiff'
image = Image.open(path)

非常感谢阅读或回答这个问题的人。

Answer 1

尝试rasterio和matplotlib

import rasterio
import matplotlib.pyplot as plt
src_path = "Your_sat_img.tif"
img = rasterio.open(src_path)
plt.figure(figsize=(22, 22))
plt.imshow(img.read([1,2,3]).transpose(1, 2, 0))

Answer 2

您可以尝试使用此代码打开任何tiff文件：

import rasterio
from rasterio.plot import show
tiff_img = rasterio.open('filename.tif')
show(tiff_img)