agnes()和hclust()做同样的事情吗？

Question

我使用clValid包(Brock等人，2008年)来评估集群解决方案的稳定性。

有趣的是，包您选择了分层聚类和AGNES，就好像它们是不同的算法一样。

利用距离度量、连锁方法和聚类算法的综合最佳组合，输出一个排序列表，其中，层次聚类和AGNES在使用相同距离度量和相同链接方法时得到不同的结果。

因此，为了得到一些明确的澄清: agnes()和hclust()真的做了完全相同的事情吗？clValid包只是误导了军衔的显示方式，还是我遗漏了什么？

Answer 1

这里是一些相关信息，详细说明了两个函数在使用Ward方法方面的差异。

它解释了hclust()使用了两种Ward方法-“ward.D”和“ward.d2”。“ward.D2”是真正的Ward方法，而“ward.D”则是另外一种方法。输入hclust()中的“ward”将导致使用“ward.D”。在agnes()中，只有一种' Ward‘选项--即真正的Ward方法。

若要了解其他类型的连接的差异，请阅读此帖子