R中的三元维恩图:如何得到正确的面积比例

Question

我试图通过使用包VennDiagram来比较R中使用venn图的不同测试方法。我遇到的问题是，面积与数字的大小不成比例。所有这些都很好，然后我比较了2种测试方法，如下所示：

draw.pairwise.venn(44, 32, 28, c("TestA", "TestB"), fill = c("red", "blue"))

但是，当我尝试比较三种方法时，区域不再成比例了。我尝试过添加一些“附加”，比如eulerr.d = TRUE和scaled = TRUE，但似乎没有帮助。

draw.triple.venn(44, 39, 32, 39, 25, 28, 25, c("TestA", "TestC", "TestB"),  fill = c("red", "green", "blue"), euler.d = TRUE, scaled = TRUE)

有什么关于如何绕过这件事的建议吗？

提前谢谢你，

比约恩

Answer 1

Venn图和Euler图都不要求重叠区域与内容的大小成比例，因此我理解它使图形稍微更有用。我强烈建议研究包UpSetR，它提供了一些非常酷和有指导意义的集合重叠图形表示。

同时，我会使用user20650的建议，与eulerr玩，看看你是否发现它更容易得到你想要的覆盖图。也是在CRAN: bvenn，venneuler，vennplot和其他几个可能感兴趣的包。

Side :如果您只是在绘制与内容重叠的内容，那么它是一个Euler图，而不是Venn图。

Answer 2

您使用的参数确实为一些值集创建了一个缩放的图。

draw.triple.venn(1, 3, 5, 0, 1, 0, 0, c("TestA", "TestC", "TestB"),  
                 fill = c("red", "green", "blue"))

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对于其他参数集，不可能(或不编码)使区域与值成比例。

Answer 3

您不能使用圆圈显示三个或多个集合的任意比例Venn或Euler图。对于不同的包，堆栈溢出中有一个关闭的线程来执行此操作。有两个选项是eulerr (格列奈特)，它使用椭圆和损耗函数，还有我开发的nVennR (格列奈特)，它使用其他形状并保持几乎精确的比例。