翻译awk命令

Question

我试图理解这句话的含义：

command = 'awk \'' + '$9 == "'+gene+'" && $4 >= ' + str(min_count) + '\' ' + filename + ' > ' + filename + '.tmp.' + gene

gene, min_count, filename是函数的参数

有人能解释一下这个命令的目的吗？

Answer 1

执行上面的python命令将得到bash命令：

awk '$9 == "$GENE" && $4 >= $MIN_COUNT' $FILENAME > $FILENAME.tmp.$GENE

假设'$XYZ‘表示python变量'XYZ’的值

它可以做到：

输入$min_count

• If的
• 打开文件"$filename.tmp.$gene“，用于输入行的输出
• ，检查第9个参数是否等于$gene

H 110检查是否满足第四个参数>=

• 的两个条件，将该行打印到输出

顺便提一句，在python中执行下面的代码将更有效，因为执行下面的代码的密码会更少。

filename="..."
gene="..."
min_count=...
inp = open(filename, 'r')
out = open(filename + '.tmp.' + gene, 'w') ;
for line in inp.readline():
    l = line.split(' ')
    if l[8] == gene and int(l[3]) >= min_count:
        out.write(line)
inp.close()
out.close()

没有经过测试的代码，因为没有需要验证的数据，应该足够接近。