如何读取R中的.edges文件？

Question

我从网络存储库(http://networkrepository.com/actor-movie.php)下载了一个网络对象。但是，我未能使用igraph::read.graph在R中加载这个.edges文件，有以下错误：

dat <- read.graph("actor-movie.edges")

Error in read.graph.edgelist(file, ...) : 
  At foreign.c:101 : parsing edgelist file failed, Parse error

有谁知道如何在R中加载这个网络吗？

Answer 1

我认为igraph::read_graph的错误是由于分隔符--在文件中它是逗号分隔的，但是函数需要format="edgelist"的空格。但是，我们可以使用标准导入工具将fie作为一个数据格式读取。然后，igraph函数可以用来形成图形。

# download
pth <- "http://nrvis.com/download/data/misc/actor-movie.zip"
download.file(pth, destfile = "actor-movie.zip")

# see file names
unzip("actor-movie.zip", list = TRUE)

# unzip
unz <- unzip("actor-movie.zip", "actor-movie.edges")

# quick look : looks like edge list
readLines(unz, n=10)

# skip first line to avoid % bipartite unweighted" 
dat <- read.table(unz, skip=1, sep=",")

# look
head(dat)
str(dat)

# load as a graph
library(igraph)

g <- graph_from_data_frame(dat)
g