如何下载整个netcdf-4文件？

Question

我想要做的是：--我一直在尝试从OPeNDAP (当前和风气象数据) be.html缓存一个文件，以便给出一个与使用OpenDrift库查询NETCDF4库数据集(be)相同的文件版本

OpenDrift库在他们的读取器档案中的原始代码如下所示：

if ('*' in filestr) or ('?' in filestr) or ('[' in filestr):
                self.logger.info('Opening files with MFDataset')
                if has_xarray:
                    self.Dataset = xr.open_mfdataset(filename)
                else:
                    self.Dataset = MFDataset(filename)
            else:
                self.logger.info('Opening file with Dataset')
                if has_xarray:
                    self.Dataset = xr.open_dataset(filename)
                else:
                    self.Dataset = Dataset(filename, 'r')

文件名为url，例如"be“

迄今尝试过的方法：

1.过滤数据以下载dataset nccopy http://thredds.met.no/thredds/dodsC/sea/norkyst800m/1h/aggregate_be?Cs_r[0:1:34],Cs_w[0:1:35],X[0:1:2601],Y[0:1:901],angle[0:1:0][0:1:0],depth[0:1:15],forecast_reference_time,h[0:1:0][0:1:0],hc,lat[0:1:0][0:1:0],lon[0:1:0][0:1:0],projection_stere,AKs[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],Uwind[0:1:0][0:1:0][0:1:0],Vwind[0:1:0][0:1:0][0:1:0],salinity[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],temperature[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],time[0:1:21690],tke[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],u[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],u_eastward[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],ubar[0:1:0][0:1:0][0:1:0],v[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],v_northward[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],vbar[0:1:0][0:1:0][0:1:0],w[0:1:0][0:1:0][0:1:0][0:1:0],zeta[0:1:0][0:1:0][0:1:0] norkyst.nc的一个子集，该子集为我提供了一个丢失了大量数据的小文件(可以作为读取器读取，但使用ncdump显示缺少ubar等数据)

2.尝试下载整个dataset nccopy -4 http://thredds.met.no/thredds/dodsC/sea/norkyst800m/1h/aggregate_be norkystFull.nc，这将导致33 at文件停止下载。(给出HDF错误)

Answer 1

THREDDS中的OPeNDAP将允许您在一次访问中下载最大数量的数据，这可能会阻止您使用一个命令下载整个聚合。您可以通过下载子集，然后在本地进行协同连接来解决这一问题。例如，如果安装了NCO公用事业，可以通过使用带有时域子设置选项的ncks将子集下载到本地netCDF文件中，然后使用ncrcat进行连接。

例如，下面将向本地文件subset.nc下载一个时间维索引为2到3(包括在内)的子集。同时，它还会将时间维度变成输出netCDF文件中的无限维度；这将使以后更容易使用ncrcat，因为这需要无限维度。

url=https://thredds.met.no/thredds/dodsC/sea/nordic4km/zdepths1h/aggregate_be

ncks -d time,2,3 --mk_rec_dmn time $url subset.nc

然后，您可以使用以下内容进行连接：

ncrcat subset1.nc [subset2.nc ...] whole_series.nc

如果不是所有变量都感兴趣，您可以使用例如-v temperature,salinity命令ncks命令下载指定的变量以及相关的坐标变量。