如何读取.tar.xz文件？

Question

我在这里下载了Gwern Branwen数据集：https://www.gwern.net/DNM-archives

我正试着阅读R中的数据集，我遇到了很多麻烦。我试图打开dataset中的一个名为"1776.tar.xz“的文件，我认为我用untar()”解压缩“了它，但是我没有得到任何超过它的东西。

untar("C:/User/user/Downloads/dnmarchives/1776.tar.xz",
  files = NULL,
  list = FALSE, exdir = ".",
  compressed = "xz", extras = NULL, verbose = FALSE, restore_times = TRUE,
  tar = Sys.getenv("TAR"))

编辑:谢谢所有的评论到目前为止！代码在基本R中，我有从Gwern网站下载的多个数据集。我只是想打开一个去探索。

Answer 1

谢谢大家！不知道r有什么问题，但我重新安装了。最后，我手动解压缩并加载文件。

Answer 2

基R包括函数untar。在我的Ubuntu19.10上运行R3.6.2，默认安装，下面就足够了。

fls <- list.files(pattern = "\\.xz")
untar(fls[1], verbose = TRUE)

注记.

在问题中，"dataset“是单数，但该网站上有几个数据集(复数)。下载我使用的文件

args <- "--verbose rsync://78.46.86.149:873/dnmarchives/grams.tar.xz rsync://78.46.86.149:873/dnmarchives/grams-20150714-20160417.tar.xz ./"
cmd <- "rsync"

od <- getwd()
setwd('~/tmp')

system2(cmd, args)

Answer 3

我发现R基的untar()在Windows上有点不可靠和/或慢。

(在所有平台上)对我非常有效的是

library(archive)
archive_extract("C:/User/user/Downloads/dnmarchives/1776.tar.xz",
                dir="C:/User/user/Downloads/dnmarchives")

它支持'tar'，'ZIP'，'7-zip'，'RAR'，'CAB'，'gzip'，‘bzip2 2’，‘压缩’，'lzma‘和'xz’格式。

还可以使用它直接读取存档中的csv文件，而不必首先使用

read_csv(archive_read("C:/User/user/Downloads/dnmarchives/1776.tar.xz", file = 1), col_types = cols())