windows上的Rpy2

Question

我想在我的windows机器上安装rpy2，它给了我以下著名的错误

      self.convert_pycparser_error(e, csource)
      File "c:\users\96171\appdata\local\temp\pip-install-lxsxk7q4\rpy2\.eggs\cffi-1.14.0-py3.6-win-amd64.egg\cffi\cparser.py", line 336, in convert_pycparser_error
        raise CDefError(msg)
    cffi.CDefError: cannot parse "void __cffi_extern_python_start; void _capsule_finalizer(SEXP); void __cffi_extern_python_stop;"
    <cdef source string>:495:96: Illegal character '\r'

    ----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in C:\Users\96171\AppData\Local\Temp\pip-install-lxsxk7q4\rpy2\

我做了以下工作：

• 升级的设置工具
• 将pip升级到最新版本

我遵循了这里在windows上安装rpy2的链接，他们说我们必须下载预编译的二进制文件才能工作。

我已经从下面的链接下载了这个轮子：rpy2‑2.9.5‑cp37‑cp37m‑win_amd64.whl，但是我仍然面临着麻烦，我做了以下工作：

• 在我下载rpy2‑2.9.5‑cp37‑cp37m‑win_amd64.whl之后
• 我以管理员身份在下载方向盘的目录中打开cmd
• 我将系统变量中的%R_USER%设置为用户名: R_USER C:\Users\my_username，但是我得到了以下错误：

ERROR: rpy2-2.9.5-cp37-cp37m-win_amd64.whl is not a supported wheel on this platform.

在双星的网站上，他们说：

Rpy2 (中断，不稳定)：为统计计算和图形提供对R软件环境的访问。需要R3.3，我的系统上有R3.6.2。这会导致错误吗？

Answer 1

旧答案

问题是我下载了错误的轮子。cp37的意思是CPython 3.7和我的系统上有python 3.6。我下载了rpy2-2.9.5-cp36-cp36m-win_amd64.whl而不是rpy2-2.9.5-cp37-cp37m-win_amd64.whl，它成功了。

此外，当我面临R_USER和R_HOME的问题时，我在python脚本中完成了以下操作：

import os
# see the following 2 lines
os.environ['R_HOME'] = 'C:/Program Files/R/R-3.6.2'
os.environ['R_USER'] = 'C:/Users/96171/AppData/Local/Programs/Python/Python36/Lib/site-packages/rpy2' #path depends on where you installed Python. Mine is the site packages of the regular python installation, it could have been Anaconda

# importing rpy2
import rpy2.robjects as robjects
r = robjects.r
r['source']('sample_r.r')

参考资料：这

更新

为了避免os calls，我能够通过将R_USER和R_HOME包含到ENVIRONMENT VARIABLES中的SYSTEM VARIABLE中来实现所需的行为。

• C:\Users\96171\AppData\Local\Programs\Python\Python36\Lib\site-packages\rpy2：R_USER
• R_HOME：C:\Program \R\R-3.6.2