blocks|key|2597345|text|下面是一个排序heatmaply列和行的解决方案，就像在pheatmap中一样|type|unstyled|depth|inlineStyleRanges|offset|length|style|CODE|entityRanges|data|2597346|phtmap+<-+pheatmap(scale(mtcars))
heatmaply(scale(mtcars),+Rowv=phtmap[[1]],+Colv=phtmap[[2]],+revC=TRUE)|code-block|syntax|javascript|2597347|pheatmap的输出|2597348|📷|atomic|2597349|​|2597350|和heatmaply的输出|2597351|2597352|2597353|entityMap|0|IMAGE|mutability|IMMUTABLE|imageUrl|https://developer.qcloudimg.com/http-save/yehe-900000/5af41deef45ee1da48ca9ccc539d82ee.png|imageAlt|1|https://developer.qcloudimg.com/http-save/yehe-900000/ffeab1e7a5f2e6b324e93234ed375a39.png^0|7|9|S|8|0|0|0|8|0|0|1|0|0|0|1|9|0|0|1|1|0|0^^$0|@$1|2|3|4|5|6|7|16|8|@$9|17|A|18|B|C]|$9|19|A|1A|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|F|3|G|5|H|7|1B|8|@]|D|@]|E|$I|J]]|$1|K|3|L|5|6|7|1C|8|@$9|1D|A|1E|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|M|3|N|5|O|7|1F|8|@]|D|@$9|1G|A|1H|1|1I]]|E|$]]|$1|P|3|Q|5|6|7|1J|8|@]|D|@]|E|$]]|$1|R|3|S|5|6|7|1K|8|@$9|1L|A|1M|B|C]]|D|@]|E|$]]|$1|T|3|N|5|O|7|1N|8|@]|D|@$9|1O|A|1P|1|1Q]]|E|$]]|$1|U|3|Q|5|6|7|1R|8|@]|D|@]|E|$]]|$1|V|3|-4|5|6|7|1S|8|@]|D|@]|E|$]]]|W|$X|$5|Y|Z|10|E|$11|12|13|-4]]|14|$5|Y|Z|10|E|$11|15|13|-4]]]]

Here is a solution to order columns and rows of <code>heatmaply</code> as in <code>pheatmap</code>:

<pre><code>phtmap &lt;- pheatmap(scale(mtcars))
heatmaply(scale(mtcars), Rowv=phtmap[[1]], Colv=phtmap[[2]], revC=TRUE)
</code></pre>

The ouput of <code>pheatmap</code>
<a href="https://i.stack.imgur.com/Ng8ii.png" rel="nofollow noreferrer"><img src="https://i.stack.imgur.com/Ng8ii.png" alt="enter image description here"></a>

and the output of <code>heatmaply</code>
<a href="https://i.stack.imgur.com/N2h4x.png" rel="nofollow noreferrer"><img src="https://i.stack.imgur.com/N2h4x.png" alt="enter image description here"></a>

I am using the R heatmaply package to produce interactive heatmaps. I like the software, but I would like to get from it the same clustering (ordering of rows and columns) I get using the pheatmap package. Therefore, I would like the two commands to produce the same ouput:

<pre><code>heatmaply (scale (mtcars))
pheatmap (scale (mtcars))
</code></pre>

Is there a way to do this? Thanks in advance. Arturo

P.S. I recently asked another similar question about the color output, i.e., not clustering, output, that was brilliantly answered here: <a href="https://stackoverflow.com/questions/61931334/r-heatmaply-and-pheatmap-output">R heatmaply and pheatmap output</a>

Clustering in pheatmap and heatmaply R packages

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功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符功能2上新100个字符。

功能5描述100个字符功能5描述100个字符功能5描述100个字符功能5描述100个字符功能5描述100个字符功能5描述100个字符

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我正在使用R热包来制作交互式热图。我喜欢这个软件，但我想从它中得到与我使用的pheatmap包相同的集群(行和列的排序)。因此，我希望这两个命令产生相同的输出：heatmaply (scale (mtcars))pheatmap  (scale (mtcars))有办法这样做吗？提前谢谢。阿图罗最近，我问了另一个关于颜色输出的类似问题，即不分簇，输出，这个问题在这里得到了很好的回答：

问在pheatmap和heatmaply R包中的聚类
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