linux环境下Rstudio系统函数的使用

Question

我在我的R脚本中有下面一行，当我在Linux环境中从命令行调用R时，

system('spectre run.scs -f psfascii +l mylog.txt >> /dev/null')

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但是当我从命令行启动RStudio运行此脚本时，同一行无法工作，

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幽灵是一个有效的命令，当R被调用时可以工作，但是当rstudio无法识别该命令时。

注意:除R之外，幽灵命令来自外部模块，在调用R和rstudio之前，我在linux终端中加载了该模块，如下所示。

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用R和RStudio的路径编辑的RStudio

当我从命令行运行哪个幽灵并检查它的路径时，

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> Sys.getenv("PATH")
[1] "/tool/eda/apps/synopsysHspice/2013.03-SP2/hspice/bin:/tool/eda/apps/synopsysHspice/2013.03-SP2/hspice/arch:/tool/eda/apps/mentorCalibre/2014.2_33.25/aoi_cal_2014.2_33.25/bin:/tool/eda/apps/cadenceMMSIM/13.11.292/tools/bin:/tool/eda/apps/cadenceMMSIM/13.11.292/bin:/tool/eda/apps/cadenceICOA/6.1.6.500.11/share/oa/bin:/tool/eda/apps/cadenceICOA/6.1.6.500.11/tools/dfII/bin:/tool/eda/apps/cadenceICOA/6.1.6.500.11/tools/bin:/tool/pandora64/bin:/tool/pandora64/sbin:/tool/pandora/bin:/tool/pandora/sbin:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/bin:/usr/bin:/opt/puppetlabs/bin"

但当我检查R演播室的路径时

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> Sys.getenv("PATH")
[1] "/tool/pandora64/.package/qt-5.5.1/bin:/tool/pandora64/.package/R-3.4.3/bin:/tool/pandora64/.package/rstudio-99.9.9/app/bin:/bin:/usr/bin:/tool/eda/apps/cadenceMMSIM/13.11.292:/tool/eda/apps/cadenceMMSIM/13.11.292"

Answer 1

评论部分的@r2evans给出了答案，

通过在命令行中复制R环境中的路径来更改Rstudio中的路径，

 Sys.setenv(PATH="/tool/eda/apps/synopsysHspice/2013.03-SP2/hspice/bin:/tool/eda/apps/synopsysHspice/2013.03-SP2/hspice/arch:/tool/eda/apps/mentorCalibre/2014.2_33.25/aoi_cal_2014.2_33.25/bin:/tool/eda/apps/cadenceMMSIM/13.11.292/tools/bin:/tool/eda/apps/cadenceMMSIM/13.11.292/bin:/tool/eda/apps/cadenceICOA/6.1.6.500.11/share/oa/bin:/tool/eda/apps/cadenceICOA/6.1.6.500.11/tools/dfII/bin:/tool/eda/apps/cadenceICOA/6.1.6.500.11/tools/bin:/tool/pandora64/bin:/tool/pandora64/sbin:/tool/pandora/bin:/tool/pandora/sbin:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/bin:/usr/bin:/opt/puppetlabs/bin")