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用Networkx可视化大型图形
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Stack Overflow用户
提问于 2020-07-17 03:39:01
回答 1查看 3.6K关注 0票数 2

我有一个node1,node2格式的数据集,并希望使用网络构建一个图形。这是一个相当大的数据集,导致一个有500 k节点的图。

代码语言:javascript
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import pandas as pd
import numpy as np
import networkx as nx

df = pd.read_csv('large.csv')
G=nx.from_pandas_edgelist(df, 'node1','node2')

这部分代码运行非常快,它将数据块转换成一个图形。然后我尝试应用弹簧布局:

代码语言:javascript
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pos = nx.spring_layout(G)

代码的这一部分要花费很长时间。如果我尝试不同的布局,比如circular_layout或shell_layout,它会非常快,但是布局与我的图形不一样。

是否有更好的方法将spring_layout应用于如此大的图形?

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2020-07-17 15:54:07

对于那些大图,我不建议使用networkx来可视化这样大的图形。替代方案是graphvizGephi。请看以下相关问题清单:

票数 3
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/62946696

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