我从一个大数据帧中分离出2组数据帧。比如说,
import pandas as pd, numpy as np
np.random.seed([3,1415])
ind1 = ['A_p','B_p','C_p','D_p','E_p','F_p','N_p','M_p','O_p','Q_p']
col1 = ['sap1','luf','tur','sul','sul2','bmw','aud']
df1 = pd.DataFrame(np.random.randint(10, size=(10, 7)), columns=col1,index=ind1)
ind2 = ['G_l','I_l','J_l','K_l','L_l','M_l','R_l','N_l']
col2 = ['sap1','luf','tur','sul','sul2','bmw','aud']
df2 = pd.DataFrame(np.random.randint(20, size=(8, 7)), columns=col2,index=ind2)
# Split the dataframes into two parts
pc_1,pc_2 = np.array_split(df1, 2)
lnc_1,lnc_2 = np.array_split(df2, 2)现在,我需要将来自df1 (pc1, pc2)的每个分离数据帧与来自df2 (ln_1,lnc_2)的每个数据帧连接起来。目前,我正在做以下工作,
# concatenate each split data frame pc1 with lnc1
pc1_lnc_1 =pd.concat([pc_1,lnc_1])
pc1_lnc_2 =pd.concat([pc_1,lnc_2])
pc2_lnc1 =pd.concat([pc_2,lnc_1])
pc2_lnc2 =pd.concat([pc_2,lnc_2])在每个级联的数据帧上,我需要运行一个相关分析函数,例如,
correlation(pc1_lnc_1)和我想单独保存结果,例如,
pc1_lnc1= correlation(pc1_lnc_1)
pc1_lnc2= correlation(pc1_lnc_2)
......
pc1_lnc1.to_csv(output,sep='\t')问题是,是否有一种方法可以使上述级联部分自动化,而不是使用某种循环(目前用于每个级联数据帧)在每一行中对其进行编码。我正在单独运行函数correlation。我有一个很长的分离数据框架的列表。
发布于 2020-07-27 14:10:17
这是另一个想法
def correlation(data):
# do some complex operation..
return data
# {"pc_1" : split_1, "pc_2" : split_2}
pc = {f"pc_{i + 1}": v for i, v in enumerate(np.array_split(df1, 2))}
lc = {f"lc_{i + 1}": v for i, v in enumerate(np.array_split(df2, 2))}
for pc_k, pc_v in pc.items():
for lc_k, lc_v in lc.items():
# (pc_1, lc_1), (pc_1, lc_2) ..
correlation(pd.concat([pc_v, lc_v])). \
to_csv(f"{pc_k}_{lc_k}.csv", sep="\t", index=False)
# will create csv like pc_1_lc_1.csv, pc_1_lc_2.csv.. in the current working dir发布于 2020-07-27 13:23:41
您可以遍历拆分的数据文件:
for pc in np.array_split(df1, 2):
for lnc in np.array_split(df2, 2):
print(correlation(pd.concat([pc,lnc])))发布于 2020-07-27 13:29:00
如果数组中没有单独的数据格式(假设您有一个非平凡的数据格式),最简单的方法(只要进行最小的代码修改)就是使用一个循环抛出一个eval。
有点像
for counter in range(0,n):
for counter2 in range(0:n);
exec("pc{}_lnc{}=correlation(pd.concat([pc_{},lnc_{}]))".format(counter,counter2,counter,counter2))
eval("pc{}_lnc{}.to_csv(filename,sep='\t')".format(counter,counter2)围绕eval的标准免责声明仍然适用(不要这样做,因为它是懒散的编程实践,而不安全的输入可能会导致代码中的各种问题)。
有关为什么使用伊瓦尔很坏的更多细节,请参见这里
编辑更新答案以回答更新的问题。
https://stackoverflow.com/questions/63116217
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