package :在“`conda‘`meta.yaml`文件中创建对”`conda形如“包的依赖关系

Question

我正在为conda-forge编写一个包，需要指定另一个conda-forge依赖项的依赖项。本质上，我需要安装conda-forge gdal包的固定版本，因为它实际上编译了支持BIGTIFF文件的libtiff版本.

现在，如果我要将gdal安装到conda环境中，我会编写类似的内容。

conda install -c conda-forge gdal=2.4.4 

在安装软件包时，我会从安装的gdal=2.4.4中获得这个版本的conda-forge。现在，在meta.yaml文件中，我可以指定类似于这样的包依赖项，但是我没有看到如何为tar文件指定一个URL，或者任何可能工作的东西。

{% set version = "0.0.1" %}

package:
  name: mypackage
  version: {{ version }}

source:
  url: https://github.com/myrepo/{{ version }}.tar.gz
  sha256: ****6a63

build:
  number: 1
  skip: true  # [win and py27]
  entry_points:
    - mycli = mypackage.main:main

requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  # <----- want to specify from conda-forge
  run:
    - python
    - gdal  # <----- want to specify from conda-forge

如能就如何做到这一点提出建议，将不胜感激。

Answer 1

我认为在meta.yaml中指定通道是不可能的。以下问题在conda构建问题跟踪器中仍未解决：https://github.com/conda/conda-build/issues/532

作为一种解决办法，如果您知道您需要的gdal的确切版本，您可以在配方中指定确切的版本和“构建字符串”。

唯一令人讨厌的是，您必须为您的食谱需要支持的平台和python版本的每一个组合列出一次gdal。

requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  2.4.4 py36h02fde04_1  # [osx and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37h622575a_1  # [osx and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38h57202bd_1  # [osx and py==38]
    - gdal  2.4.4 py36hbb8311d_1  # [linux and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37hf8c3989_1  # [linux and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38hfe926b7_1  # [linux and py==38]

  run:
    - python
    - gdal  2.4.4 py36h02fde04_1  # [osx and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37h622575a_1  # [osx and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38h57202bd_1  # [osx and py==38]
    - gdal  2.4.4 py36hbb8311d_1  # [linux and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37hf8c3989_1  # [linux and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38hfe926b7_1  # [linux and py==38]

(我抄袭了在conda锻造通道上的gdal包列表上的那些。)

顺便说一句，既然您提到对您来说真正重要的区别是libtiff，那么您应该将libtiff而不是gdal钉在一起吗？或者两者都有？

编辑：

最好避免在host和run部分中重复构建字符串的整个列表。

正如您在注释中所建议的，一个选项是在conda_build_config.yaml中定义构建字符串。

# conda_build_config.yaml
gdal_build:
  - py36h02fde04_1  # [osx and py==36]
  - py37h622575a_1  # [osx and py==37]
  - py38h57202bd_1  # [osx and py==38]
  - py36hbb8311d_1  # [linux and py==36]
  - py37hf8c3989_1  # [linux and py==37]
  - py38hfe926b7_1  # [linux and py==38]

# meta.yaml
requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_build }}

  run:
    - python
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_build }}

另一个选项是直接在meta.yaml中在jinja变量中定义查找表。这可能会稍微丑陋一些，但至少所有的逻辑都包含在一个文件中。我不知道该选哪一种。

{% set platform = 'linux' if linux else 'osx' if osx else 'win' %}

{%
  set gdal_builds = {
    'osx': {
      36: 'py36h02fde04_1',
      37: 'py37h622575a_1',
      38: 'py38h57202bd_1',
    },
    'linux': {
      36: 'py36hbb8311d_1',
      37: 'py37hf8c3989_1',
      38: 'py38hfe926b7_1',
    }
  }
%}

requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_builds[platform][py] }}

  run:
    - python
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_builds[platform][py] }}