我有一个通过rstudio创建的项目,它使用GUI并按下(New )按钮。下面是我如何用renv创建项目的一些快照。我的操作系统是Ubuntu20.04LTS。


到目前为止,renv已经创建了常见的可疑文件和文件夹:.Rprofile renv/activate.R renv/library
它还没有创建renv.lock。我相信这是因为在创建文件夹时我从未调用过renv::snapshot()。
然后,我开始在我的项目上正常工作,并通过调用install.packages()安装了几个包。例如,dplyr就是其中之一。但是,我注意到,当我关闭项目并调用installed.packages()时,项目中安装的相同包也会安装在外部。我认为renv的工作方式类似于python中的conda环境,packages是从其他环境中分离出来的。我在这里错过了什么?我的直觉是,renv并不是一个真正像conda那样的虚拟环境。
当我在我的项目中运行libPaths()时,我得到到renv/library的路径和一个/tmp/...路径:
[1] "/home/alex/Documents/GitHub/CIMMYT/renv/library/R-4.0/x86_64-pc-linux-gnu"
[2] "/tmp/RtmpdfQT46/renv-system-library" 当我在项目之外运行libPaths()时,我得到:
[1] "/home/alex/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0"
[2] "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib/R/site-library"
[4] "/usr/lib/R/library" 发布于 2020-09-22 21:17:03
然后,
开始在我的项目上正常工作,并通过调用install.packages()安装了几个包。例如,dplyr就是其中一个包。但是,我注意到,当我关闭项目并调用installed.packages()时,项目中安装的相同包也安装在外部。我认为renv的工作方式类似于python中的conda环境,它将包与其他环境隔离开来。我在这里错过了什么?我的直觉是,renv实际上不是像python的conda那样的虚拟环境。
这里最有可能的答案是,这些包也在单独的时间点被安装到用户库中。
如果您可以将其提取为一个可重复的示例,您可以在https://github.com/rstudio/renv/issues上提交一个问题。然而,据我所知,一切都如愿以偿,安装到用户库中的软件包可能是通过其他机制实现的。
https://stackoverflow.com/questions/63987757
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