利用ggplot2与朱莉娅普卢图笔记本电脑

Question

我正在使用一个Pluto.jl笔记本电脑。我想使用ggplot2 R库来制作一些情节。

在这个例子之后，如果我在Julia中运行以下代码，那么我可以得到一个ggplot2图输出。

using RCall
@rlibrary ggplot2
using DataFrames
df = DataFrame(v = [3,4,5], w = [5,6,7], x = [1,2,3], y = [4,5,6], z = [1,1,2])
ggplot(df, aes(x=:x,y=:y)) + geom_line()

现在，当我在pluto.jl笔记本中使用相同的代码(每行都是一个单独的单元格)时，我会得到以下错误消息：

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有办法让ggplot2图像出现在冥王星笔记本中吗？

类似地，如果我只是在一个单元格中输入ggplot()，我会得到相同的错误，但是ggplot not defined。

Answer 1

使用@library，Pluto.jl似乎无法找到R包。

然而，冥王星可以处理这种格式：

@rimport ggplot2 as ggplot2

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在点击“播放”按钮3或4次后，我设法看到了这张照片。这是好消息的结束--RCall的整合是不稳定的。图表显示在一个似乎挂着的单独窗口中--这也许是一个打开问题的故事。

但是，您可以尝试将图像保存到文件中，而不是将其可视化：

begin
    ggplot2.ggplot(df, ggplot2.aes(x=:x, y=:y)) +  ggplot2.geom_line()
    ggplot2.ggsave("myplot.png")
    im1 = Images.load("myplot.png")
end

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Answer 2

作为一种解决办法，可以用以下方法手动重写Base.show (请参阅Pluto.jl/sample/test1.jl)

function Base.show(io::IO, ::MIME"image/png", p::RObject{VecSxp})
    (path, _) = mktemp()
    R"ggsave($path, plot=$p, device = 'png')"
    im = read(path)
    rm(path)
    write(io, im)
end

在此之后，输出任何类型RObject{VecSxp}的单元格将显示PNG映像：

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