将libpq.5.dylib复制到/usr/lib/libpq.5.dylib

Question

我无法在R中加载包，因为文件libpq.5.dylib不在/usr/lib/libpq.5.dylib中。它在/usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib里

我试过这句话：sudo ln -s /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib /usr/lib/libpq.5.dylib，但我得到了这样的回复：ln: /usr/lib/libpq.5.dylib: Operation not permitted

如何才能在不引起问题的情况下在/usr/lib/libpq.5.dylib中获取文件？这个solution建议我可能会面临问题，所以我不知道该怎么做。

Answer 1

你真的不希望它出现在/usr/lib中。苹果宣布这是禁止使用的，而在较新的macOS版本上，它只能使用只读版本。除非您愿意进入恢复模式并手动篡改卷(并可能在将来的操作系统更新中重复此操作)，否则这不是一条路。

相反，让我们讨论一下核心问题：

macOS上的动态库将自己的安装路径嵌入到二进制文件中，链接器将其复制到针对二进制文件的二进制文件中。可以用install_name_tool更改此信息(请参阅man install_name_tool)。

1. 检查dylib的安装名称：

otool /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib -l fgrep -A2 LC_ID_DYLIB

如果打印的路径已经指向dylib本身(或与其有符号链接的路径)，请使用下面的[new_path]路径，并跳过步骤2.。

如果dylib的安装名称没有指向自身，则运行

1. ：

数独/usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib install_name_tool -id

并将/usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib用于下面的[new_path] .

对于链接到dylib的二进制文件，运行

1. ：

sudo install_name_tool -change /usr/lib/libpq.5.-change new_path

Answer 2

我也遇到了同样的问题:安装了RPostgres，但是库无法加载，同样的错误消息。由于我已经在我的机器上安装了Postgres，所以我认为这个问题已经解决了，因此我在本地没有这样的消息；但是下面是我如何在我的dockerfile中解决这个问题的方法，在一个与安装R无关的机器上100%地验证了这个问题：

RUN apt-get update && apt-get install libpq5 -y

因此，在您的终端上执行apt-get update && apt-get install libpq5 -y应该可以做到这一点。轻巧高效。