我有一个数据集,每个病人有一行,它包含关于病人服用11次药物的日期(格式化为SAS日期)的信息。在数据集中,每天最多有一剂药物。患者可以在1到11剂量之间的任何地方确定日期,而且没有中间剂量缺少信息(例如,如果Dose5被填充,定义为Dose1-Dose 4被填充)。我感兴趣的是病人连续服用一剂药的最长天数。这里有5行数据样本。
data have;
input PATIENT_ID Dose1 :ddmmyy10. Dose2 :ddmmyy10. Dose3 :ddmmyy10. Dose4 :ddmmyy10. Dose5 :ddmmyy10. Dose6 :ddmmyy10. Dose7 :ddmmyy10. Dose8 :ddmmyy10. Dose9 :ddmmyy10. Dose10 :ddmmyy10. Dose11;
format Dose1 Dose2 Dose3 Dose4 Dose5 Dose6 Dose7 Dose8 Dose9 Dose10 Dose11 ddmmyy10.;
cards;
1 01/01/2020 01/02/2020 01/03/2020 01/04/2020 01/05/2020 01/06/2020 01/07/20 1/08/2020 01/09/2020 01/10/2020 01/11/2020
2 01/01/2020 01/02/2020 01/03/2020 01/05/2020 01/06/2020
3 01/02/2020 01/04/2020 01/06/2020 01/08/2020 01/10/2020 01/12/2020 01/14/2020 01/16/2020 01/18/2020
4 01/03/2020 01/04/2020 01/05/2020 01/06/2020 01/07/2020 01/08/2020 01/09/2020 1/10/2020 01/12/2020 01/13/2020
5 01/01/2020 01/07/2020 01/08/2020 01/10/2020
;
run;我想得到变量MAX_CONSECUTIVE_DAYS:
data want;
input PATIENT_ID MAX_CONSECUTIVE_DAYS Dose1 :ddmmyy10. Dose2 :ddmmyy10. Dose3 :ddmmyy10. Dose4 :ddmmyy10. Dose5 :ddmmyy10. Dose6 :ddmmyy10. Dose7 :ddmmyy10. Dose8 :ddmmyy10. Dose9 :ddmmyy10. Dose10 :ddmmyy10. Dose11;
format Dose1 Dose2 Dose3 Dose4 Dose5 Dose6 Dose7 Dose8 Dose9 Dose10 Dose11 ddmmyy10.;
cards;
1 11 01/01/2020 01/02/2020 01/03/2020 01/04/2020 01/05/2020 01/06/2020 01/07/20 1/08/2020 01/09/2020 01/10/2020 01/11/2020
2 3 01/01/2020 01/02/2020 01/03/2020 01/05/2020 01/06/2020
3 1 01/02/2020 01/04/2020 01/06/2020 01/08/2020 01/10/2020 01/12/2020 01/14/2020 01/16/2020 01/18/2020
4 8 01/03/2020 01/04/2020 01/05/2020 01/06/2020 01/07/2020 01/08/2020 01/09/2020 1/10/2020 01/12/2020 01/13/2020
5 2 01/01/2020 01/07/2020 01/08/2020 01/10/2020
run;到目前为止,我只能想出如何用蛮力零碎地做这件事。
data bruteforce;
set have;
if Dose2 =. then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=1;
else if Dose3=. then
do;
if Dose2-Dose1=1 then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=2;
else MAX_CONSECUTIVE_DAYS=1;
end;
else if Dose4=. then
do;
if Dose3-Dose1=2 then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=3;
else if (Dose2-Dose1=1) or (Dose3-Dose2=1) then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=2;
else MAX_CONSECUTIVE_DAYS=1;
end;
else if Dose5=. then
do;
if Dose4-Dose1=3 then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=4;
else if (Dose3-Dose1=2) or (Dose4-Dose2=2) then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=3;
else if (Dose2-Dose1=1) or (Dose3-Dose2=1) or (Dose4-Dose3=1) then MAX_CONSECUTIVE_DAYS=2;
else MAX_CONSECUTIVE_DAYS=1;
end;
/*And so on and so forth until accounting for rows where Dose10 is populated*/
run;然而,在我的实际工作中,有超过200剂量的药物,所以用if-然后-else语句做一系列do循环是没有意义的。如果我不得不猜测,解决方案可能与数组有关,但我不知道从何处或如何开始。
发布于 2020-11-02 09:07:10
首先,谢谢你清楚地解释了你的问题和你迄今所做的努力:
只是一张纸条。我将您的输入数据更改为具有mmddyy10格式/格式的日期。我想你想要的是连续数数,而不是几个月。
不管怎样,试试这个。请随便问
data have;
infile datalines missover;
input PATIENT_ID (Dose1 - Dose11)(:mmddyy10.);
format Dose: mmddyy10.;
cards;
1 01/01/2020 01/02/2020 01/03/2020 01/04/2020 01/05/2020 01/06/2020 01/07/2020 1/08/2020 01/09/2020 01/10/2020 01/11/2020
2 01/01/2020 01/02/2020 01/03/2020 01/05/2020 01/06/2020
3 01/02/2020 01/04/2020 01/06/2020 01/08/2020 01/10/2020 01/12/2020 01/14/2020 01/16/2020 01/18/2020
4 01/03/2020 01/04/2020 01/05/2020 01/06/2020 01/07/2020 01/08/2020 01/09/2020 1/10/2020 01/12/2020 01/13/2020
5 01/01/2020 01/07/2020 01/08/2020 01/10/2020
;
data want(drop=c i);
set have;
array dose {*} Dose:;
c = 1;
do i = 2 to dim(dose);
if dose[i] - dose[i-1] = 1 then c + 1;
else do;
if c > mc then mc = c;
c = 1;
end;
end;
if mc = . then mc = c;
run;结果:
PATIENT_ID Dose1...Dose11 mc
1 ... 11
2 ... 3
3 ... 1
4 ... 8
5 ... 2 发布于 2020-11-02 11:01:40
正确,基于变量的array将允许您遍历日期并计算最长的运行时间。
提示:尽可能使用表示值内容的变量名。dose<n>的元信息比dose_date<n>少。
稳健的计算将检查或说明边缘情况,如没有剂量。
样本代码:
从数组中提取值需要很小的CPU成本(也许可以忽略不计)。假设数组名为x。循环内的计算x[index]-x[index-1]重复这样的代价。
例如:x[5]−[x4]和x[6]−x[5]。将提取的值存储在变量中将减少重复成本。
Data选项keep=是要输出的变量的显式列表。或者,可以使用drop=_:来排除工人变量(在本示例中),其名称以_开头。
data have;
infile datalines missover; input
ID X1-X11; format _numeric_ 4.; datalines;
1 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11
2 01 02 03 05 06
3 02 04 06 08 10 12 14 16 18
4 03 04 05 06 07 08 09 10 12 13
5 01 07 08 10
6 01
7
8 01 03 05 07 09 11 13 15 17 19 21
;
data want(keep=id x: rl_max);
set have;
array X X:;
if not missing(x1) then _rl = 1; /* preset if not an edge case */
_p = x1;
rl_max = _rl;
do _index = 2 to dim(X);
_q = X[_index]; /* store extracted value in worker variable */
if missing(_q) then leave; /* iterate as little as needed */
if _q - _p = 1 then /* consecutive */
_rl = sum (_rl, 1);
else do; /* gap, check and reset */
if _rl > rl_max then rl_max = _rl;
_rl = 1;
end;
_p = _q; /* current to previous */
end;
if _rl > rl_max then rl_max = _rl; /* no gaps */
run;https://stackoverflow.com/questions/64640866
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