带有postgres的DOCKER容器，警告:无法打开统计文件"pg_stat_tmp/global.stat"：不允许操作

Question

我使用.yml、Dockerfile等从几个不同的映像构建了一个DOCKER容器。到目前为止，一切都很好，除了我在标题中提到的这个问题：

index-db_1   | 2021-02-22 23:18:33.388 UTC [31] WARNING:  could not open statistics file "pg_stat_tmp/global.stat": Operation not permitted

数据库索引映射到Docker包根目录中主机上的一个文件夹，就数据库而言，其他一切似乎都正常。我使用的是Mac，但是如果我列出了CLI对DB文件夹的权限，我将获得：

-rw-------@  1 sscotti  staff      3 Feb 22 11:01 PG_VERSION
drwx------@  6 sscotti  staff    192 Feb 22 11:54 base
drwx------@ 60 sscotti  staff   1920 Feb 22 16:00 global
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_commit_ts
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_dynshmem
-rw-------@  1 sscotti  staff   4782 Feb 22 11:02 pg_hba.conf
-rw-------@  1 sscotti  staff   1636 Feb 22 11:01 pg_ident.conf
drwx------@  5 sscotti  staff    160 Feb 22 17:46 pg_logical
drwx------@  4 sscotti  staff    128 Feb 22 11:01 pg_multixact
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_notify
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_replslot
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_serial
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_snapshots
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 16:00 pg_stat
drwx------@  5 sscotti  staff    160 Feb 22 17:50 pg_stat_tmp
drwx------@  3 sscotti  staff     96 Feb 22 11:01 pg_subtrans
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_tblspc
drwx------@  2 sscotti  staff     64 Feb 22 11:01 pg_twophase
drwx------@  4 sscotti  staff    128 Feb 22 11:01 pg_wal
drwx------@  3 sscotti  staff     96 Feb 22 11:01 pg_xact
-rw-------@  1 sscotti  staff     88 Feb 22 11:01 postgresql.auto.conf
-rw-------@  1 sscotti  staff  28073 Feb 22 11:01 postgresql.conf
-rw-------@  1 sscotti  staff     36 Feb 22 16:00 postmaster.opts
-rw-------   1 sscotti  staff     94 Feb 22 16:00 postmaster.pid

pg_stat文件夹实际上是空的。

pg_stat_temp有：

-rw-------  1 sscotti  staff   1952 Feb 22 17:54 db_0.stat
-rw-------  1 sscotti  staff  20360 Feb 22 17:54 db_13395.stat
-rw-------  1 sscotti  staff   1151 Feb 22 17:54 global.stat

.yml文件具有以下内容：

  index-db:
      image: postgres
      restart: unless-stopped
      volumes:
          - ./OrthancIndex:/var/lib/postgresql/data

因为它是一个码头容器，所以它是可以忽略的。

在UBUNTU.上添加了关于相同设置的注释

数据库文件夹：

数据库：

drwx------ 6 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jun 11 13:00 base
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jun 30 13:12 global
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_commit_ts
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_dynshmem
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump  4782 Mar 12 16:12 pg_hba.conf
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump  1636 Mar 12 16:12 pg_ident.conf
drwx------ 4 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jul  1 13:27 pg_logical
drwx------ 4 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_multixact
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_notify
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_replslot
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_serial
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_snapshots
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jun 30 13:12 pg_stat
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jul  1 13:29 pg_stat_tmp
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jun 24 21:04 pg_subtrans
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_tblspc
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_twophase
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump     3 Mar 12 16:12 PG_VERSION
drwx------ 3 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Jul  1 12:37 pg_wal
drwx------ 2 systemd-coredump systemd-coredump  4096 Mar 12 16:12 pg_xact
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump    88 Mar 12 16:12 postgresql.auto.conf
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump 28073 Mar 12 16:12 postgresql.conf
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump    36 Jun 30 13:12 postmaster.opts
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump    94 Jun 30 13:12 postmaster.pid

pg_stat_temp

-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump  2660 Jul  1 13:30 db_0.stat
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump 31157 Jul  1 13:30 db_13395.stat
-rw------- 1 systemd-coredump systemd-coredump  1151 Jul  1 13:30 global.stat

我在UBUNTU:上得到了同样的错误

postgres_index-db_1   | 2021-07-01 18:06:45.140 UTC [266] WARNING:  could not open statistics file "pg_stat_tmp/global.stat": Operation not permitted
postgres_index-db_1   | 2021-07-01 18:13:45.583 UTC [273] WARNING:  could not open statistics file "pg_stat_tmp/global.stat": Operation not permitted
postgres_index-db2_1  | 2021-07-01 18:19:43.716 UTC [282] WARNING:  could not open statistics file "pg_stat_tmp/global.stat": Operation not permitted
postgres_index-db2_1  | 2021-07-01 18:21:43.749 UTC [284] WARNING:  could not open statistics file "pg_stat_tmp/global.stat": Operation not permitted

虽然在这里，用户和组是系统核心。

Answer 1

为我未来的自我写下这篇文章，也是为了回答这个问题:看看文献资料，并在上面采用@Fide的解决方案，下面的内容似乎适用于运行PostGIS映像(它只是建立在Postgres图像之上的).

请注意，这是从shell脚本中获取的，用于在主机系统上启动具有持久本地存储的Postgres+PostGIS映像：

WORK_DIR="$HOME/Documents/git/project"
DOCKER_NM="postgis"
DOCKER_IMG="postgis/postgis"
POSTGRES_PWD="XXX"
PORT_NO="5432"
docker run --name $DOCKER_NM \
    -e POSTGRES_PASSWORD=$POSTGRES_PWD \
    -e PGDATA=/var/lib/postgresql/data/pgdata \
    -v "$WORK_DIR/data/postgres":/var/lib/postgresql/data \
    -p "$PORT_NO:5432" -d $DOCKER_IMG \
    postgres -c stats_temp_directory=/tmp

如果您直接从终端运行(即不通过zsh/bash运行)，那么需要对每个参数进行export，而不是仅仅指定它们。

有了这个，global.stat错误似乎已经消失了.不过，我应该注意到，我刚刚弄清楚了这一点，并且运行了不到60分钟的容器。另一种方法是按照页面上的说明创建和使用从本地FS挂载的持久性自定义conf文件(扩展@SScotti的上面的注释)：

-v "$PWD/my-postgres.conf":/etc/postgresql/postgresql.conf

Answer 2

简单哑

我尝试过另一种方法:将临时文件留在容器中，在容器中不需要处理用户权限--这是有效的。通过内联命令，我已经更改了docker-Compose.yml中的Postgresql配置：

postgresdb:    
    image: 'postgres'
    command: postgres -c stats_temp_directory=/tmp
    .
    .
    .

这是快速而简单的解决方案，但它不设置多个postgres配置参数。我找到了另一个解决方案。

高级 (added on 22/01/14 09:00PM CET)

高级解决方案包括以下步骤：

1. 准备您想要的postgresql.conf -在这里您可以设置您需要的任何postgres服务器参数。解决这个线程中的问题的必要方法是：

stats_temp_directory = '/tmp/stat_temporary'

1. 创建bash文件，您将开始在docker-compose.yml中使用docker-compose.yml，您将使用该文件将配置复制到停靠库中的postgres配置目录中，并创建临时文件夹。

如果您以这种方式设置了docker-compose.yml：

postgres-db:
    image: postgres
    container_name: 'dbcontainer'
    volumes:
      # point to your postgres init scripts (folder or file)
      - $PWD/db_init:/docker-entrypoint-initdb.d
      # if you need persistent data, point data to local folder
      - $PWD/database:/var/lib/postgresql/data
      # if you want some data restore, point to your backup
      - $PWD/db_backup:/db_backup
      # point docker to directory with your config
      - $PWD/db_config:/db_config

然后，数据库将插入db_init目录中的脚本。(也可以直接指向一个sql或bash文件。如果指向目录，init脚本将按字母顺序运行所有文件。您将放置在db_init文件夹中的带有init脚本的文件可以如下所示，并将在docker中启动：

echo starting script...
# create temporary directory for postgres in docker
mkdir /tmp/stat_temporary 

# copy your postgresql.conf to postgresql config location in docker
cp /db_config/postgresql.conf var/lib/postgresql/data/postgresql.conf

# alternatively you can run any pg script you need, here I restore backup to new database
pg_restore -U postgres -v -Fc -d analysis /db_backup/analysis_backup.bak
echo finished

运行此脚本后，将重新启动对接器上的数据库服务，并使用设置的新参数加载数据库服务。

Answer 3

使用本地卷进行安装需要在postgres容器中进行用户映射。/postgres自述文件中有一节名为“任意--用户备注”(user Notes )，它描述了问题的解决方案。

列出的建议之一是使用停靠卷，初始化已安装卷的内容，关闭容器映像，运行递归所有权更改，然后正常重新启动容器。

$ docker volume create pgdata
$ docker run -it --rm -v pgdata:/var/lib/postgresql/data -e POSTGRES_PASSWORD=mysecretpassword postgres
The files belonging to this database system will be owned by user "postgres".
...
( once it's finished initializing successfully and is waiting for connections, stop it )
$ docker run -it --rm -v pgdata:/var/lib/postgresql/data bash chown -R 1000:1000 /var/lib/postgresql/data
$ docker run -it --rm --user 1000:1000 -v pgdata:/var/lib/postgresql/data postgres