“Rmarkdown中的导入pandas`”：在控制台中工作，但不编织

Question

我正在尝试在RStudio中的Rmarkdown文件中编写Python代码。一般来说，它工作得很好。我可以编写代码块并完美地编织它们。我还可以导入和使用包:任何使用numpy或math的东西都可以运行和编织良好。

尽管能够运行和编织使用其他包的代码块，但当文件包含使用pandas的块时，我似乎无法编织它。我可以运行这些块并获得预期的输出。一个最起码的例子就是：

import pandas as pd

返回(预期的)输出：

Python 3.9.4 (/usr/local/bin/python3)
Reticulate 1.20.9000 REPL -- A Python interpreter in R.

(我还可以使用pandas函数运行代码块。)

问题是，当我编织的时候，我得到了一个错误：

Error in py_call_impl(callable, dots$args, dots$keywords) : ModuleNotFoundError: No module named 'pandas' Detailed traceback: File "<string>", line 1, in <module> File "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/reticulate/python/rpytools/loader.py", line 44, in _import_hook level=level Calls: <Anonymous> ... py_capture_output -> force -> <Anonymous> -> py_call_impl Execution halted

我不明白为什么我能够运行这些代码块，但不能编织它们。

谢谢你的帮助!

Answer 1

对于一个简单的例子，您的Rmarkdown文件看起来有点类似吗？

---
title: "Untitled"
author: "User"
date: "5/6/2021"
output: html_document
---

    
```{r setup, include=FALSE}

图书馆(网状)

```{python}

将熊猫作为pd导入

iris = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/mwaskom/seaborn-data/master/iris.csv')

虹膜

你还会犯错吗？有时你可能需要重新安装pip软件包，通常pip3 install pandas工作，你也可以在你的r块中添加py_install("pandas")在library(reticulate)下面，让它安装熊猫来帮助它正确渲染。有时，简单的例子有助于将问题分解成更小的块。