如何解压缩`.tgz`目录，并将其中一个文件解压缩到内存中？

Question

TL；博士

如何解压缩文件.tgz，然后选择性地压缩输出？我提取的dir有几个文本文件和一个.nii文件。我想稍后再给你拉链。

详细信息

第一种方法是按顺序执行。不过，我正在处理存储在BeeGFS文件系统上的一个巨大数据集( BeeGFS tar存档)，有人告诉我，最好分两步在内存中这样做，因为BeeGFS不喜欢处理这样的大目录。

顺序法：

for tarfile in ${rootdir}/*.tgz; do
  tarpath="${tarfile%.tgz}"
  tar zxvf ${tarfile}       # (1) untar directory
  gzip ${tarpath}/*.nii     # (2) gzip the .nii file
done

有没有一种将(1)和(2)结合起来的方法？或者，对于如何有效地完成这一过程，您还有其他的建议吗？

谢谢!

Answer 1

您可以从归档文件中提取单个文件(如果您知道文件名)，并让tar将其写入标准输出，而不是用-O将其写入文件，然后压缩该流并将其重定向到文件。有点像

tar xzOf "$tarfile" "$tarpath/foo.nii" | gzip -c > "$tarpath/foo.nii.gz"

然后，您可以使用tar xzf "$tarfile" --exclude "*.nii"解压缩存档中的其他所有内容。