MissForest中的并行化

Question

我有一个数据data3，有54个因子，数值变量和285331个记录。但是，如果我使用以下代码，我将使用MissForest包填充NAs，并尝试并行化，以减少处理时间：

library(missForest)
library(doParallel)
library(foreach)
data4 <- missForest(data3, maxiter = 10, ntree = 100, mtry = 100, variablewise = T, parallelize = "forests")
data4$OOBerror
apply(data3,2,var,na.rm=TRUE) 
apply(is.na(data4$ximp),2,sum) 
data3 <- data4$ximp

我收到这个错误：

Error in missForest(data3, maxiter = 10, ntree = 100, mtry = 100, variablewise = T, : You must register a 'foreach' parallel backend to run 'missForest' in parallel. Set 'parallelize' to 'no' to compute serially.

为了让它发挥作用，缺少了什么？

Answer 1

您需要"doParallel“包(见下文)

library(doParallel)
registerDoParallel(cores = 16)