python中的布尔值函数

Question

该函数(filteredFastaToYear)使用另一个不工作的布尔值函数(filterHeaderToYear) .我非常感谢你的帮助：

我的任务如下：

我给出了我的第一个函数(filteredFastaToYear)两个列表：

sequences_inp = ['ABC', 'DEF', 'GHI', 'JKL', 'MNO']  
headers_inp = ['2019-9', '2021-2', '2020-1', '2021-5', '2021-8']

作为输出，我只需要2021年的头和归属序列：

sequences_out = ['DEF', 'JKL', 'MNO']  
headers_out = ['2021', '2021', '2021']

I类型：

sequences_out, headers_out = filteredFastaToYear('2021', sequences_inp, headers_inp)
print(len(sequences_out), len(headers_out))

但是，根据预期的输出，我得到了空列表：

output: 0 0
expected output: 3 3

函数filteredFastaToYear:创建两个筛选列表

def filteredFastaToYear(year, listOfSequences, listOfHeaders):

    """ output filtered sequence list, header list """
    filtListOfSequences = []
    filtListOfHeaders = []

    """ fasta filtering """
    for i in range(0, len(listOfHeaders)-1):
        if filterHeaderToYear(year, listOfHeaders[i]) == year:
            filtListOfSequences.append(listOfSequences[i])
            filtListOfHeaders.append(listOfHeaders[i])

    return filtListOfSequences, filtListOfHeaders

函数filterHeaderToYear:从所需的年份中选择标题：

def filterHeaderToYear(year, listOfHeaders):

    """ split header, find the needed year """
    for header in listOfHeaders:
        header_split = header.split('-')
        if header_split[0] == year:
            return True

    return False

Answer 1

您可以保存自己的bug搜索，并这样做：

out = [(s, h[:4]) for s, h in zip(sequences_inp, headers_inp) if h[:4] == '2021']

若要将成对列表“解压缩”到所需的两个列表中，请使用zip(* )技巧：

s, h = list(zip(*out))

Answer 2

您将输入年份本身划分为代码。

    for header in listOfHeaders:
        header_split = header.split('-')

这将将2021-19拆分为[2,0,2,1,-,1,9]，您还在if filterHeaderToYear(year, listOfHeaders[i]) == year上放置了一个检查，它将永远作为方法返回True或False，并且您正在与year进行比较。

此外，您也不会通过以下操作来迭代完整列表

for i in range(0, len(listOfHeaders) - 1)

它会在最后一个位置之前停止一个位置。

尝试这段代码

def filteredFastaToYear(year, listOfSequences, listOfHeaders):
    """ output filtered sequence list, header list """
    filtListOfSequences = []
    filtListOfHeaders = []

    """ fasta filtering """
    for i in range(0, len(listOfHeaders)):
        if filterHeaderToYear(year, listOfHeaders[i]):
            filtListOfSequences.append(listOfSequences[i])
            filtListOfHeaders.append(listOfHeaders[i])

    return filtListOfSequences, filtListOfHeaders

def filterHeaderToYear(year, listOfHeaders):

    """ split header, find the needed year """
    header_split = listOfHeaders.split('-')
    if header_split[0] == year:
        return True

    return False

sequences_inp = ['ABC', 'DEF', 'GHI', 'JKL', 'MNO']
headers_inp = ['2019-9', '2021-2', '2020-1', '2021-5', '2021-8']

sequences_out, headers_out = filteredFastaToYear('2021', sequences_inp, headers_inp)
print(len(sequences_out), len(headers_out)) # 3,3