无法在R中安装软件包探测

Question

我整个早上都在R里安装Sleuth软件包，它一直给我带来错误。我就是这样安装它的：

if(!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))  
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("DESeq2") 

BiocManager::install ("rhdf5")
install.packages("devtools") 
devtools:: install_github("pachterlab/sleuth")

我确实使用了library()命令。

我得到以下错误消息: Error: object 'h5write.default‘不是由’命名空间:rhdf5 5‘导出的，执行暂停错误:延迟加载程序包'sleuth’失败

• 去除'C:/Users/31625/OneDrive/Documents/R/win-library/4.1/sleuth‘

Answer 1

我也有同样的问题，并发现目前有一个开放的问题上讨论这个问题。

目前，有一种解决办法在同一问题上得到了分享：

• 运行git clone https://github.com/pachterlab/sleuth
• 删除./sleuth/命名空间中的最后一行，这是在安装过程中引发错误的h5write.default --忽略第一行中的警告
• 然后在R：devtools::install('./sleuth/')中

它在使用和R4.1.2时对我起了作用，但它也应该在Windows上工作。

有人也打开了一个PR来解决整个问题，但是似乎是，他们不再更新这个包了(不幸的是)。