如何将pymol模块嵌入到python中？

Question

我在E:\{my\folder\directory}\pymol2\PyMOL-2.3.2_81-Win64-portable-py37\PyMOL\PyMOLWin.exe上安装了pymol

C:\Python36上安装了python

但是，在Pycharm中运行python脚本时，import pymol收到ModuleNotFoundError: No module named 'pymol'错误。我认为，这是因为python环境中没有嵌入pymol模块。

我想知道如何在python中嵌入pymol模块

Answer 1

在PyMOL support FAQ's中，它指出PyMOL很可能不能与system Python安装一起工作。

但是，PyMOL附带了一个python发行版，它应该位于此目录中。(E:\{my\folder\directory}\pymol2\PyMOL-2.3.2_81-Win64-portable-py37\PyMOL\python.exe)。其中包含PyMOL python包(NumPy、BioPython等)。PyMOL\Lib\site-packages中的所有内容都已安装完毕。PyMOL附带了conda包管理器，因此如果您缺少某个包，可以使用Conda-Prompt将其与conda一起安装。

如果你已经有了Anaconda发行版，你可以直接用以下命令安装：

conda install -c schrodinger pymol-bundle

然后，您只需要在PyCharm中更改项目解释器，您就可以轻松完成任务了！