在R脚本文件中使用较早版本的ggplot

Question

我在Ubuntu22.04上安装了ggplot2 3.4.0，但出于某些原因，我想使用旧版本的ggplot2 3.3.6。

library(ggplot2, lib.loc="~/R/ggplot336/") 

当我开始使用一个干净的脚本文件时，我工作得很好。但是，当我使用现有脚本文件时，如下所示：

library(ggplot2, lib.loc="~/R/ggplot336/") 
ggimage::geom_image()

我得到了以下错误信息：

value3L中的错误:包‘ggplot2’版本3.4.0无法卸载:unloadNamespace中的错误(包)：名称空间‘ggplot2’是由‘is value3L’、‘ggplotify’、‘ggimage’导入的，因此不能卸载

编辑

1. Rstudio
2. 用以下3行打开我的R脚本文件：

sessionInfo()
library(ggplot2, lib.loc="~/R/ggplot336/") 
ggimage::geom_image()

当我运行第一行时，在执行其他任何操作之前都是sessionInfo()。我们可以在那里看到ggplot2_3.4.0。这是一个Rstudio特性还是一个问题？

R version 4.2.2 Patched (2022-11-10 r83330)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 22.04.1 LTS

Matrix products: default
BLAS:   /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.10.0
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.10.0

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_AU.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_AU.UTF-8       
 [4] LC_COLLATE=en_AU.UTF-8     LC_MONETARY=en_AU.UTF-8    LC_MESSAGES=en_AU.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_AU.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_AU.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.9         highr_0.9          pillar_1.8.1       compiler_4.2.2    
 [5] R.utils_2.12.2     R.methodsS3_1.8.2  yulab.utils_0.0.5  tools_4.2.2       
 [9] digest_0.6.30      evaluate_0.18      jsonlite_1.8.3     lifecycle_1.0.3   
[13] tibble_3.1.8       gtable_0.3.1       ggimage_0.3.1      R.cache_0.16.0    
[17] pkgconfig_2.0.3    rlang_1.0.6        reprex_2.0.2       DBI_1.1.3         
[21] cli_3.4.1          ggplotify_0.1.0    rstudioapi_0.14    magick_2.7.3      
[25] yaml_2.3.6         xfun_0.35          fastmap_1.1.0      knitr_1.41        
[29] withr_2.5.0        dplyr_1.0.10       styler_1.8.1       generics_0.1.3    
[33] vctrs_0.5.1        fs_1.5.2           gridGraphics_0.5-1 grid_4.2.2        
[37] tidyselect_1.2.0   glue_1.6.2         R6_2.5.1           processx_3.8.0    
[41] fansi_1.0.3        rmarkdown_2.18     clipr_0.8.0        callr_3.7.3       
[45] ggplot2_3.4.0      purrr_0.3.5        magrittr_2.0.3     ps_1.7.2          
[49] htmltools_0.5.3    scales_1.2.1       assertthat_0.2.1   colorspace_2.0-3  
[53] utf8_1.2.2         munsell_0.5.0      ggfun_0.0.9        R.oo_1.25.0       

Answer 1

在做了一些实验之后，我就算出了这个问题。因为这占用了我太多的时间，我想这会对其他人有所帮助。

问题是使用:: (双冒号)的包使用ggplot2，例如我的示例中的ggimage。在打开脚本文件时，RStudio似乎会自动加载一些依赖的包。现在解决此问题的一种方法是删除::，而是使用library()然后函数(geom_image)。

这解决了我的问题，但我仍然不明白为什么RStudio会这样做。

如果需要:: (双冒号)，请注释包含::的行，然后在加载旧版本的ggplot2之后，取消对这些行的注释。有点尴尬，但对我有用。

Answer 2

看起来session正在从前一个会话中加载所有以前的库。也许是.RData或.Rhistory里遗留下来的东西。一个新的R的开始应该有非常少的加载库。

这是我的新开始：

sessionInfo()
R version 4.2.2 (2022-10-31)
Platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)
Running under: macOS Monterey 12.6.1

Matrix products: default
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.2.2 tools_4.2.2  

在Rstudio的首选项中，您应该看到这个屏幕：

​

​

我会尝试取消检查所有的框，然后退出并重新启动Rstudio，以确定这是否清除了问题。