R:在R-4.1.1中从源代码安装GWmodel包时出错

Question

我正在尝试从GWmodel网站的源代码安装软件包这。运行install_github(lbb220/GWmodel/GWmodel)后，我将收到以下错误：Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub: Line starting '<<<<<<< HEAD ...' is malformed!

我想从源代码安装软件包而不使用install.packages("GWmodel")的原因是我想使用parallel.method = "cuda"。在文档中，它说：

在GWR函数中使用CUDA进行高性能计算的要求:要在gwr.basic、bw.gwr和gwr.model.selection中运行GWR(即指定为“cuda”)，需要满足以下条件：

至少有一个NVIDIA GPU支持用户计算机上的CUDA。CUDA (>10.2)的环境变量'CUDA_HOME‘设置正确。包应该从源重新构建。-对于Linux用户，如果编辑人员能够检测到CUDA工具包，就会自动生成“GWmodelCUDA”。-对于Windows用户，“GWmodelCUDA.dll”和“GWmodelCUDA.lib”将自动下载；但是，我们建议用户手动构建“GWmodelCUDA”库，以避免一些潜在的未知问题，并为此过程提供了一个“CMakeLists.txt”文件。如果上述任何条件不满足，GWR将无法工作，即使“parallel.method”被指定为“cuda”。

如果我使用install.github()安装它，我将得到我提到的错误。我已经安装了CUDA (>10.2)，并正确设置了环境变量'CUDA_HOME‘。

如果我使用install.packages("GWmodel")，就不会有任何错误。我还尝试下载GWmodel.zip并从本地zip文件中安装，但也有相同的错误。

我已经成功地安装了rtools (我使用示例这里测试了它)

我正在使用R.Studio 1.4.1717，R 4.1.1和Windows 11。

我该怎么做呢？

我使用了install_github("lbb220/GWmodel")，虽然我没有收到上面的错误，但是安装仍然不能完成。我现在收到以下信息：

** libs

*** arch - i386
"C:/rtools40/mingw32/bin/"g++ -std=gnu++11  -I"C:/PROGRA~1/R/R-41~1.1/include" -DNDEBUG  -I'C:/Program Files/R/R-4.1.1/library/Rcpp/include' -I'C:/Program Files/R/R-4.1.1/library/RcppArmadillo/include'     -ARMA_64BIT_WORD=1 -fopenmp   -O2 -Wall  -mfpmath=sse -msse2 -mstackrealign  -c GWmodel.cpp -o GWmodel.o
GWmodel.cpp: In function 'double sp_gcdist(double, double, double, double)':
GWmodel.cpp:764:29: error: 'DOUBLE_EPS' was not declared in this scope
     if (fabs(lat1 - lat2) < DOUBLE_EPS) {
                             ^~~~~~~~~~
GWmodel.cpp:764:29: note: suggested alternative: 'ENABLE_NLS'
     if (fabs(lat1 - lat2) < DOUBLE_EPS) {
                             ^~~~~~~~~~
                             ENABLE_NLS
GWmodel.cpp: In function 'void printMat(arma::mat)':
GWmodel.cpp:1165:16: warning: comparison of integer expressions of different signedness: 'const uword' {aka 'const unsigned int'} and 'int' [-Wsign-compare]
   if (m.n_rows < n)
       ~~~~~~~~~^~~
make: *** [C:/PROGRA~1/R/R-41~1.1/etc/i386/Makeconf:245: GWmodel.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'GWmodel'
* removing 'C:/Program Files/R/R-4.1.1/library/GWmodel'
Warning message:
In i.p(...) :
  installation of package ‘C:/Users/GEOGRA~1/AppData/Local/Temp/RtmpOwWBPs/file8f43609514d/GWmodel_2.2-0.tar.gz’ had non-zero exit status

Answer 1

这是因为您实际上并不是从主存储库安装的。试试install_github(lbb220/GWmodel)。