如何在Pyvis中更清楚地显示图形？

Question

我想在Pyvis中可视化一个图形，它的节点有标签。我完全能够在Pyvis中看到它，但我的问题是它的可视化方式。在Pyvis中显示的图形不清楚，边被弄乱了。有什么方法可以更清晰地可视化图形吗？下面的图片显示了图表。

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例如，在图中，节点15显示得很好。我希望其他节点以清晰的方式显示，这样连接就可以更清楚地显示。

更新：--这是我使用绘制图形的代码：

    def showGraph(FileName, labelList):

        Txtfile = open("./results.txt")
        G = nx.read_weighted_edgelist(Txtfile)
        Txtfile.close()

        palette = (sns.color_palette("Pastel1", n_colors=len(set(labelList.values())))) 
        palette = palette.as_hex()
        colorDict = {}
        counter = 0
        for i in palette:
            colorDict[counter] = i
            counter += 1

        N = Network(height='100%', width='100%', directed=False, notebook=False)
        for n in G.nodes:
            N.add_node(n, color=(colorDict[labelList[n]]), size=5)
        for e in G.edges.data():
            N.add_edge(e[0], e[1], title=str(e[2]), value=e[2]['weight'])

        N.show('result.html')

results.txt是我的边缘列表文件，labelList保存每个节点的标签。标签是数字的。例如，节点48的标签是5，它可以是任何东西。我使用标签为节点提供不同的颜色。

Answer 1

NetworkX 圆形布局倾向于使单个节点和它们之间的连接更易于查看，因此只要您不希望节点在绘制之后移动(而不拖动)，您就可以尝试这样做。

在创建pyvis网络之前，在NetworkX图上运行以下命令创建一个字典，该字典将由节点键控并以(x，y)位置作为值。您可能需要稍微处理一下scale参数，看看什么最适合您。

pos = nx.circular_layout(G, scale = 1000)

然后，在添加每个节点时，可以将x和y值从pos添加到pyvis网络。添加physics = False使节点保持在一个位置，除非单击并拖动它们。

for n in G.nodes:
    N.add_node(n, 
        color=(colorDict[labelList[n]]),
        size=5,
        x = pos[n][0],
        y = pos[n][1],
        physics = False)

我不确定边缘权重将如何发挥作用，所以您可能也应该添加physics = False到add_edge参数，以确保什么都不会移动。

因为我没有您的原始数据，所以我只生成了一个有10个节点的随机图，这就是pyvis中的结果。

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