通过匹配文本文件bash中的键值来重命名文件

Question

我在目录中有以下文件：

./PBMCs/SRR1_1.fastq
./PBMCs/SRR1_2.fastq
./Monos/SRR2.fastq
./Monos/SRR3.fastq

我想根据键值对的文件将SRR#更改为信息更丰富的名称：

SRR1 pbmc-1
SRR2 mono-1
SRR3 mono-2

并将文件重命名为：

./PBMCs/pbmc-1_1.fastq
./PBMCs/pbmc-1_2.fastq
./Monos/mono-1.fastq
./Monos/mono-2.fastq

我所能做的就是循环遍历原始文件的列表，然后循环遍历名称Change.txt文件的行并替换字符串。但是，我不知道如何实现这个，或者它是否是一个很好的方法来处理这个问题。

Answer 1

假设所有*.fastq都有一个子目录深度，这应该可以正常工作：

while read old new; do
  for fastq in ./*/"$old"*.fastq; do
    new_name=$new${fastq##*/"$old"}
    echo mv "$fastq" "${fastq%/*}/$new_name"
  done
done <name-change.txt

如果输出看起来不错，请删除echo。