像折叠这样的项目如何与你的电脑沟通以解决蛋白质折叠问题？

Question

像折叠“家庭”这样的程序是如何工作的？我的电脑

1. 单独在它上执行一个“工作”单元，完全独立于运行折叠@home的其他计算机？然后在回答完成后将其发回？

1. 或to折叠@home将连接到它的所有计算机看作一个项目，假设有1000个核心，然后当工作完成时，就相当于说一些类似于

Answer 1

像折叠@Home和BOINC这样的项目是松散耦合并行计算的例子，在这种情况下，每个任务都是完全独立的，无需与其他计算实体通信就可以完成。它们也是一种称为控制器/工作者(以前称为主/工作者)的模式的例子，在这种模式中，中央控制器将一个大型任务分解成一个小型(呃)子任务池，并以先到先得的方式将其分配给一组工作进程，这与您的第一点相对应。

在F@H (和BOINC)中，客户端计算机连接到服务器，请求任务，直到任务完成，然后再连接到服务器，返回结果并请求一个新任务。这样做的好处是自动负载平衡、容错(通过冗余)和不需要调度。

当您运行make -j #cores时，make会启动许多并行作业，但是这些作业通常是相互依赖的，因此make必须以最优的方式对它们进行调度。然后，作业作为进程在同一台计算机上运行，这将为make提供完整的进程控制。如果生成步骤失败，整个构建作业将立即中止，用户可以快速查看问题，修复问题，并重新启动构建。这不是一个可行的模型，因为客户端计算机可以具有任意的计算速度，可以在任何时候连接和断开连接，并且/或决定简单地停止处理任务。有一些make的分布式版本，比如dmake，它们在不同的远程节点上运行构建过程的不同部分，但是这种情况仍然发生在一个严格控制的环境中，通常是在构建集群上。

请注意，在非常高的抽象级别上，这两者基本上是等价的，主要的区别在于工作是被推送还是被拉出来的。尽管作业拉动在各种系统上都能很好地工作，但作业推送通常要求(紧密耦合的)系统具有可预测的特性和良好的调度算法。