如何从脚本构建命令行包？

Question

我花了很多时间从事生物信息学项目，并制作了大量的脚本，现在我想用它们构建一个运行在命令行终端中的生物信息学软件，并附带昂贵的手册和二进制文件。我希望能够1.保护代码，2.不需要计算多个脚本，让它变得更好；3.与任何感兴趣的人共享代码。

因为我真的不知道从哪里开始，所以我想问一下这个话题的方向。我一直在阅读关于脚本编译的文章，我认为这是可行的，但是我有三种不同编码语言的脚本，主要是python和bash，所以我还没有看到任何关于这个具体案例的教程。

共享资源(视频、手册、软件等)的任何帮助或者说给小费是值得赞赏的。我知道这是一个非常开放的问题，所以开放的答案也是受欢迎的。

Answer 1

您可以使用python解析库来构建接受参数和标志的命令行应用程序。使用此方法，您可以为用户输入提供标志，并根据用户输入运行不同的脚本，包括bash脚本。

https://realpython.com/command-line-interfaces-python-argparse/

类似地，您可以在bash脚本中这样做，该脚本为用户提供选项，并根据输入运行其他脚本。

https://www.redhat.com/sysadmin/arguments-options-bash-scripts

我不知道你说保护密码是什么意思？据我所知，如果您的意思是隐藏代码，那么要想共享脚本，就不能轻易地隐藏bash和python代码或将它们转换为二进制文件。