我正在尝试使用CytoKegg在Cytoscape上覆盖数据在KEGG路径上。在从KEGG上传KGML文件后,取决于哪条路径,我要么不让Cytoscape应用程序交互,要么接收到此错误消息:错误加载KEGG索引,长度为1。
我以前已经成功地使用了猕猴的WNT &黑色素生成途径,但现在第二种途径出现在这些通路上。我想使用刺猬的路径,让#1发生。自从成功地完成这个任务以来,我唯一改变的是我目前不在美国--我不认为这会影响到这个应用程序或KEGG,但我不知道还会发生什么变化。
任何帮助都是非常感谢的,所以提前谢谢!
发布于 2022-08-25 16:40:15
您可以尝试与此页面中列出的应用程序作者联系,看看他们是否可以帮助:https://apps.cytoscape.org/apps/cykeggparser,如果失败,还有另一个可以导入KGML文件的Cytoscape:https://apps.cytoscape.org/apps/keggscape
克里斯
https://stackoverflow.com/questions/73182994
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