医学图像叠加轮廓

Question

我试图绘制一个图像的轮廓，并使它覆盖到原来的图像，但没有填充，我希望它显示为一个边缘轮廓，而不是一个填充的轮廓，如附图。

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我使用了这个命令，但问题是当我使用LabelOverlay函数时，图像对比度发生了变化！虽然我需要保持相同的图像强度，有什么办法解决它吗？代码是: sitk_show(SimpleITK.LabelOverlay(imgOriginal1，SimpleITK.LabelContour(ImgOriginal2))

Answer 1

我鼓励你去看看陈腐 --这是一个软件包，我是一个开发人员，并且已经为可视化构建了一些很好的工具。

下面是一个示例：

import SimpleITK as sitk
from platipy.imaging import ImageVisualiser

img = sitk.ReadImage("./CT.nii.gz")
mask = sitk.ReadImage("./MASK_LUNGS.nii.gz")

vis = ImageVisualiser(img)
vis.add_contour(mask)
fig = vis.show()

fig.savefig("example.jpeg", dpi=300)

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这个工具是高度定制的，请查看关于Github :-)的文档。)