Plink和Cygwin

Question

我使用Linux是非常新的。我需要使用一些通常在Linux中运行的程序(plink；https://www.cog-genomics.org/plink/和ldsc：https://github.com/bulik/ldsc)。我是一个windows用户，我安装了Cygwin来模仿Linux。但是，我不能让他们发挥作用。我已经下载了所有文件并将它们解压缩到主目录中，但是它们不能工作。命令行不识别这些命令。

关于如何使用Cygwin运行这些程序，有什么想法吗？

提前谢谢你。带着所有美好的祝愿。

Answer 1

解决方案1(容易)

在https://www.cog-genomics.org/plink/上使用Windows版本

解决方案2(更困难)，因为代码缺乏任何Autoconf/Cmake配置设置。

构建需要的软件包: make，gcc-g++，liblapack-devel，cygwin-devel，zlib-devel

下载tar.gz格式的源代码

https://github.com/chrchang/plink-ng/releases?page=1

然后

tar -xf plink-ng-2.00a3.3.tar.gz
cd plink-ng-2.00a3.3
ln -s /usr/include zlib-1.2.11
cd 1.9
make ZLIB="-lz" BLASFLAGS="-llapack -lblas"