spatstat库中缺少的函数(如Kest和rpoint)

Question

我正在尝试使用Kest函数(以及spatstat包中的许多其他函数)。

我制作了ppp点模式数据集(ppp.1)

(ppp.1)平面点图:189个点平均强度为每平方单位241122300点

坐标给出了小数点6位

窗口:矩形= 40.74603，40.74662 x -111.84693，-111.8456单位(0.000592×0.001324单位)窗口面积= 7.83834e-07平方单位

当我尝试使用Kest函数: Kest(ppp.1)时，我得到以下错误:Kest中的错误(ppp.1)：未能找到函数"Kest"

事实上，spatstat包中有许多无法找到的函数(例如，rpoint).我也会犯同样的错误。

这是否与加载spatstat库时找不到"spatstat.random“有关：错误：”spatstat“所需的包‘spatstat.random’无法找到

我正在使用最新版本的R和spatstat (在英特尔Mac上)：r版本4.2.1 (2022-06-23) --“滑稽的孩子”版权(C) 2022 -R基金会统计计算平台: x86_64-apple-darwin17.0 (64位)

spatstat 2.3-4直接从R.

谢谢。

Answer 1

不久前，spatstat是一个包含您提到的所有功能的大型包，但由于CRAN的技术要求，它现在被分成几个较小的包，它们都是根据方案spatstat.xxxx命名的，比如spatstat.random。包spatstat现在是一个伞式包，几乎没有任何功能，但它依赖于spatstat.random和其他程序包，当您在R控制台中执行library(spatstat)时，它会加载所有这些包。

在正常情况下，R应该拒绝在没有所有所需的子包的情况下安装spatstat，但是看起来没有spatstat.random就安装了spatstat。可能最简单的解决方案是删除spatstat并重新安装它：

remove.packages("spatstat")
install.packages("spatstat", dependencies = TRUE)

或者，您可以尝试(已经安装了一个相对较新的spatstat版本)：

pkgs <- spatstat::spatstat.family()
install.packages(pkgs)

Answer 2

要查找有关包的信息，您可以访问它的CRAN页面(转到cran.r-project.org并查找贡献包)。

用于spatstat的CRAN页面说spatstat 2.3-4需要包spatstat.random和spatstat.core。这意味着spatstat依赖于这些其他包中提供的代码。

您的错误消息说spatstat.random丢失了。这就解释了为什么没有找到随机生成函数rpoint。

正如@EgeRubak所说，最好的解决方案是删除并重新安装spatstat。