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社区首页 >问答首页 >交叉和交叉中的spatstat整数溢出误差

交叉和交叉中的spatstat整数溢出误差
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Stack Overflow用户
提问于 2022-06-14 11:18:45
回答 2查看 59关注 0票数 0

我正在64位windows 10 pro机器上使用R4.1.0中的spatstat 2.3-4。最近,我在使用Kcross时遇到了整数溢出错误,使用了大量的点数(即组合数超过了.Machine$integer.max)。例如:

代码语言:javascript
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W <- as.owin(list(xrange = c(688.512, 17879.746) , yrange = c(-27996.842, -7759.813))) 
cells1 <- runifpoint(n = 8062, win = W)
cells2 <- runifpoint(n = 1768988, win = W) 
cells3 <- superimpose(tumor = cells1 , bcell = cells2)
Kcross(cells3 , r = seq(0,200,by=5) , "tumor" , "bcell" , correction="none") # error
# Error in if (nXY <= 1024) { : missing value where TRUE/FALSE needed 
# In addition: Warning message: In nX * nY : NAs produced by integer overflow 
8062 * 1768988 > .Machine$integer.max
# [1] TRUE

经过许多挣扎之后,我意识到错误来自于crosspairs的这一部分

代码语言:javascript
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if (spatstat.options("crosspairs.newcode")) {
      nXY <- nX * nY
      if (nXY <= 1024) {
          nsize <- 1024
      }  

我可以通过更改spatstat选项:spatstat.options("crosspairs.newcode" = FALSE)来“修复”错误。

这是处理错误的方法吗?

更新: As Adrian.Baddeley在下面回答,现在是在GitHub上的一个新的spatstat.geom版本(当前:2.4.-0.029),其中错误是修复的。新版本在不改变选项的情况下运行良好。

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回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-06-15 02:04:04

这个错误在spatstat.geom的开发版本GitHub存储库中得到了修正。

票数 1
EN

Stack Overflow用户

发布于 2022-06-14 19:14:11

这是一些相对较新的代码中的一个bug,用于加速底层函数crosspairs.ppp()。在新版本的spatstat.geom可用之前,您可以按照建议设置spatstat.options("crosspairs.newcode" = FALSE)来解决这个问题。

票数 1
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/72616066

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