Anaconda Python环境包冲突

Question

我正在努力解决一些python环境问题。我已经用conda create --no-default-packages --name env_novers python=3.8.5创建了一个干净的环境。一旦激活此环境，conda list将返回

# Name                    Version                   Build  Channel
ca-certificates           2022.4.26            haa95532_0
certifi                   2022.5.18.1      py38haa95532_0
openssl                   1.1.1o               h2bbff1b_0
pip                       21.2.2           py38haa95532_0
python                    3.8.5                h5fd99cc_1
setuptools                61.2.0           py38haa95532_0
sqlite                    3.38.3               h2bbff1b_0
vc                        14.2                 h21ff451_1
vs2015_runtime            14.27.29016          h5e58377_2
wheel                     0.37.1             pyhd3eb1b0_0
wincertstore              0.2              py38haa95532_2

然后，我在文章的底部执行了conda env update --name env_novers --file .\environment_novers.yml文件。这使我难以理解的一页又一页的冲突。这不仅是一个“干净”的环境，而且更新文件没有指定任何版本。当然，最终，我确实打算指定一些版本最小值，但已经迭代到了这个非版本文件(因此名！)试图调试冲突。对我来说最大的障碍是冲突似乎毫无意义。例如，在这里随机选择一个：

Package cryptography conflicts for:
urllib3 -> cryptography[version='>=1.3.4']
urllib3 -> pyopenssl[version='>=0.14'] -> cryptography[version='>=1.3|>=1.9|>=2.1.4|>=2.2.1|>=2.8|>=3.3|>=35.0|>=3.2']

我将此理解为指定urllib3需要crypto>=1.3.4，而pyopenssl需要(带有一堆of )crypto>=1.3。因此，如果conda安装了密码1.3.4，那么所有的要求都可以满足。冲突在哪里？

我已经安装(在Win 64上)最新的anaconda和运行完整的conda更新。在没有指定python 3.8.5的情况下，我尝试了所有这些，并得到了相同的内容。禁用通道优先级似乎也不会改变任何东西。救命啊！

environment_novers.yml

channels:
  - pytorch
  - plotly
  - anaconda
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - boto3
  - certifi
  - chart-studio
  - dash
  - dask
  - dask-ml
  - dbfread
  - dvc=2.1.0 # version required for backwards compatibility
  - geopandas
  - ipdb
  - ipython
  - ipywidgets
  - joblib
  - jupyter
  - jupyterlab
  - matplotlib
  - nodejs
  - numpy
  - openpyxl
  - pandas
  - pip
  - plotly
  - pyinstaller
  #- python=3.8.5 # python version pinned
  - python-dateutil
  - pytorch
  - regex
  - requests
  - scipy
  - seaborn
  - sqlalchemy
  - statsmodels
  - urllib3
  - pip:
    - geopy
    - pandas-profiling
    - scikit-learn
    - tensorflow
    - xlrd

Answer 1

conda的默认解决程序似乎太慢，无法解决这个环境/无法解决它。我建议你跑

conda install libmamba

然后再次尝试解决这个环境。我也建议你搬家

    - geopy
    - pandas-profiling
    - tensorflow
    - scikit-learn
    - xlrd

到您的文件中安装的conda包，并使用所有规范创建环境：

文件env.yml

name: env_novers 
channels:
  - pytorch
  - plotly
  - anaconda
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - boto3
  - certifi
  - chart-studio
  - dash
  - dask
  - dask-ml
  - dbfread
  - dvc=2.1.0 # version required for backwards compatibility
  - geopandas
  - ipdb
  - ipython
  - ipywidgets
  - joblib
  - jupyter
  - jupyterlab
  - matplotlib
  - nodejs
  - numpy
  - openpyxl
  - pandas
  - pip
  - plotly
  - pyinstaller
  - python=3.8.5 # python version pinned
  - python-dateutil
  - pytorch
  - regex
  - requests
  - scipy
  - seaborn
  - sqlalchemy
  - statsmodels
  - urllib3
  - geopy
  - pandas-profiling
  - scikit-learn
  - xlrd
  - tensorflow

用conda env create -f env.yml创建环境

或者，您可以考虑使用mamba

conda install mamba
mamba env create -f env.yml