linux系统迁移后的错误Conda路径

Question

我们的服务器被更新为使用NFS系统，以前的/scratch路径现在映射到/local/scratch。我的anaconda3是在/scratch/xxx/anaconda3下安装的，这基本上意味着它现在是在/local/scratch/xxx/anaconda3下。直观地，我已经在.bash_profile中更新了.bash_profile变量，运行which conda实际上给了我

/local/scratch/xxx/anaconda3/bin/conda

但是，当我实际尝试运行$conda时，系统会在下面报告错误：

-bash: /scratch/xxx/anaconda3/bin/conda: No such file or directory

这非常奇怪，表示与which conda返回的结果不一致。此外，我还试图直接将cd转换为/local/scratch/xxx/anaconda3/bin/并执行$./conda。它报告

-bash: ./conda: /scratch/xxx/anaconda3/bin/python: bad interpreter: No such file or directory

我的猜测是，除了.bash_profile中的环境变量之外，还有存储在其他地方的anaconda的一些内部设置，因为系统实际上知道python的正确路径，而conda试图从旧路径执行python (即上述错误消息中的/scratch/xxx/anaconda3/bin/python )。然而，我似乎无法找到这个文件，并将其更改以使其正常工作。

不知何故，我觉得这应该是一个常见的问题，但是，我没有从互联网上找到任何解决方案。如有任何建议，将不胜感激。

Answer 1

我已经用cpr (@merv的学分)解决了我的问题。在这里，我发布了详细的说明，所以如果有人有同样的问题，他/她几乎可以遵循他们，以使事情解决。

1.安装

根据anaconda.org，建议安装cpr的命令是

$ conda install -c anaconda conda-prefix-replacement

您可能会发现这实际上非常尴尬；我们需要cpr的原因是由于前缀问题，我们的conda被破坏了，如果我们可以运行conda命令来安装cpr，那么我们为什么需要cpr？

相反，我们可以直接从github安装cpr：

$ git clone https://github.com/conda/conda-prefix-replacement.git
$ cd conda-prefix-replacement
$ python setup.py install

2.返乡

安装之后，运行rehome命令修复前缀问题非常简单。假设您的anaconda正在从path_A迁移到path_B，只需做

$ cpr rehome path_B --old-prefix path_A

在我的例子中，命令应该是

$ cpr rehome /local/scratch/xxx/anaconda3 --old-prefix /scratch/xxx/anaconda3

运行cpr命令后，退出终端并重新登录.一切都应该好起来了！