无法在python上安装pyimagej

Question

我需要用jupyter笔记本编写代码，但需要imagej包。我使用几个命令安装了pyimagej

conda install -c conda-forge pyimagej
conda install -c conda-forge/label/cf201901 pyimagej
conda install -c conda-forge/label/cf202003 pyimagej

但是我总是收到这样的错误: ModuleNotFoundError:当我尝试时，没有名为'ij‘的模块

from ij import IJ

我知道我可以使用imagej编辑器，但我需要使用jupyter笔记本。有人能帮忙吗？

Answer 1

我试过了，成功了

conda create -n imagej pyimagej

Answer 2

我们最近改进了关于如何使用PyImageJ的文档。看起来你成功地安装了这个软件，但是你还没有初始化PyImageJ。检查一下如何初始化PyImageJ。如果初始化PyImageJ有问题，则可能需要查看安装文档。

但是，假设您已经安装了PyImageJ并激活了您的环境，一个典型的脚本如下所示：

import imagej

# initialize PyImageJ
ij = imagej.init('sc.fiji:fiji', mode='interactive')
print(f"ImageJ Version: {ij.getVersion()}")

# The original ImageJ "IJ" is a property of the initialized "ij" object.
print(dir(ij.IJ))

希望这能帮上忙！