有什么方法可以运行pingouin.anova分析的循环吗？

Question

我相信这很简单，但我仍然在学习巨蟒。我需要帮助，找出如何在熊猫数据中的列上迭代，并为每个列运行pingouin分析。从现在起，我可以跑了

pg.anova(data=df, dv='variable1', between='Group', detailed=True)

虽然我得到了我想要的结果，但我有180个变量，因此能够自动实现这一点将有很长的路要走。如果有一种方法也可以将p值结果作为向量添加到dataframe中，我将非常感激。或者，只要我能够将anova结果绑定到每个变量名，就可以将结果保存在另一个文件中。

Answer 1

anova的结果是熊猫Dataframes，因此很容易将它们附加到单个DataFrame中，您只需创建一个新变量就可以识别每个因变量：

import pingouin as pg
import pandas as pd

# load data
df = pg.read_dataset('mixed_anova')
# list of dependent variables
dep_vars = ['Scores', 'Subject']
# List with anova results 
list_results = []

for dv in dep_vars:
  # run anova and create dv variable to identify dependent variable
  aov = pg.anova(data=df, dv=dv, between='Group', detailed=True)\
    .assign(dv=dv)
  # append to list of results
  list_results.append(aov)

# concat all results into a DataFrame
df_results = pd.concat(list_results, axis=0)

# Export to Excel
df_results.to_excel('results.xlsx')
df_results

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DataFrame df_results包含所有的Anova结果，变量dv帮助您识别因变量。结果也被导出到Excel中。如果只需要p值和dep变量，则可以筛选此df：

df_results.query('Source=="Group"').filter(['p-unc', 'dv'])

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