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社区首页 >问答首页 >如何使用Python反向提取蛋白质序列的一部分

如何使用Python反向提取蛋白质序列的一部分
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Stack Overflow用户
提问于 2022-05-05 05:42:49
回答 2查看 112关注 0票数 -5

假设我有一个蛋白质序列列表:

代码语言:javascript
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VLQSDLYTLSSSVTV
WKLYSKVKPLLNVAR
YNTSLRTMPTMIWTW
GVDFYSTITRARFEE

我只想从序列中提取最后4个残基(最后4个字符)(按反序排列),例如

代码语言:javascript
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VTVS
RAVN
WTWI
EEFR

如何使用Python代码实现这一点?

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回答 2

Stack Overflow用户

发布于 2022-05-05 05:45:59

通过对清单的理解:

代码语言:javascript
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a = ['VLQSDLYTLSSSVTV', 'WKLYSKVKPLLNVAR', 'YNTSLRTMPTMIWTW', 'GVDFYSTITRARFEE']
b = [x[::-1][0:4] for x in a]

每个x都是列表a中的一个字符串。部分x[::-1]反转该字符串。通过...[0:4]提取反串的前四个字符。列表b包含这些结果中的每一个。

票数 4
EN

Stack Overflow用户

发布于 2022-05-05 05:46:19

代码语言:javascript
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s = "VLQSDLYTLSSSVTV WKLYSKVKPLLNVAR YNTSLRTMPTMIWTW GVDFYSTITRARFEE"
words = s.split()
for word in words:
    print(word[-1:-5:-1])
票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/72122422

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