数据不是公认的冲积物形式。

Question

我试图做一个冲积图，比较排序方法后，聚类。其思想是在x轴上有3个变量，对应于PCA、PCoA和PLN模型。

我想将其中的每一部分“分割”成4部分(由我的分层聚类给出的4组)。

这是我的数据集：

data_alluvial <- read.table(text = "
Var1 Freq method
1     1    4    ACP
2     2    9    ACP
3     3    8    ACP
4     4    4    ACP
5     1    6 PLNPCA
6     2    7 PLNPCA
7     3    5 PLNPCA
8     4    7 PLNPCA
9     1    8   PCoA
10    2    4   PCoA
11    3    9   PCoA
12    4    4   PCoA", header = TRUE)

以下是我尝试过的：

ggplot(data = data_alluvial, aes(x = method, stratum = Var1, alluvium = Freq, label = Var1)) + geom_alluvium(aes(fill = Var1))

我收到这样的信息：

数据不是一个公认的冲积层形式(详见help('alluvial-data') )。

我真的不明白我的dataset...can有什么问题，有人帮我吗？

Answer 1

试试这个：

#convert to factor
data_alluvial$Var1 <- as.factor(data_alluvial$Var1)

ggplot(data = data_alluvial,
       aes(x = method, y = Freq, alluvium = Var1, 
           fill = Var1, stratum = Var1)) +
  geom_alluvium() +
  geom_stratum()

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