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社区首页 >问答首页 >如何仅使用命令行解压conda/mamba中的固定包

如何仅使用命令行解压conda/mamba中的固定包
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Stack Overflow用户
提问于 2022-04-05 17:42:36
回答 1查看 713关注 0票数 2

我有一个conda环境,其包固定如下:

代码语言:javascript
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Pinned packages:
  - python 3.8.*
  - bcbio-gff 0.6.7.*
  - snakemake 6.7.0.*

如何仅使用命令行conda / mamba删除固定包的引脚

我试过了conda update snakemake,但这并不能移除引脚。

我可以很容易地改变引脚,例如通过conda install snakemake=7,但我有snakemake仍然固定。我想彻底解开snakemake

我看了一下可能类似的问题,但似乎没有人回答我的问题。

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-04-05 18:09:40

这只是一个不太理想的答案,但这是迄今为止我所能找到的最好答案:

您需要从一个名为pinned的配置文件中手动删除固定的包,您可以在

代码语言:javascript
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CONDA_PATH/base/envs/ENV_NAME/conda-meta/pinned

就我而言,我不得不这样做:

代码语言:javascript
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vim /usr/local/Caskroom/mambaforge/base/envs/nextstrain/conda-meta/pinned

并移除线:

代码语言:javascript
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snakemake=6.7.0

如果有一个conda CLI命令会好得多,但它似乎不存在。

票数 2
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/71756172

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