R无法在conda环境中加载in。

Question

我正试图在Windows的RShiny安装中运行一个WSL2应用程序。我不是R方面的专家，但我觉得这是由于conda与R的交互而产生的问题，我运行以下命令：

conda create -n r_env r-essentials r-base
conda activate r_env
conda install -c conda-forge r-shiny
conda install -c r r-visnetwork
conda install -c conda-forge r-dplyr
conda install -c r r-dt
conda install -c conda-forge r-igraph
conda install -c r r-leaflet
conda install -c conda-forge r-rgdal
conda install -c r r-shinydashboard
conda install -c conda-forge r-shinywidgets
conda install -c conda-forge r-shinycssloaders
conda install -c conda-forge r-igraph

当我运行R并输入：library(igraph)时，我得到：

->Error: package or namespace load failed for ‘igraph’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/home/carlo/anaconda3/envs/r_env/lib/R/library/igraph/libs/igraph.so':

但我可以列出来，它就在那里：

ll /home/carlo/anaconda3/envs/r_env/lib/R/library/igraph/libs/igraph.so
-> -rwxrwxr-x 1 carlo carlo 3816608 Mar 31 15:38 /home/carlo/anaconda3/envs/r_env/lib/R/library/igraph/libs/igraph.so

有人遇到过类似的问题吗？

igraph库的目的是正确地加载

Answer 1

(我的看法)我要警告不要使用r通道和r-essentials包。Continuum/Anaconda对R的支持是一种不错的尝试，但后来被Conda Forge提供的更广泛的CRAN支持所取代。管理R环境的用户将发现更好的体验，忽略任何连续体/Anaconda文档，只对他们的R环境使用Conda Forge。(终结意见)

混合通道可以导致符号引用错误。此外，特殊安装的顺序低于标准--而是通过YAML指定。

以下YAML文件在linux-64、osx-64和win-64平台上运行良好：

​

so-igraph.yaml

name: so-igraph
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - r-base=4.1  # adjust to desired version
  - r-shiny
  - r-visnetwork
  - r-dplyr
  - r-dt
  - r-igraph
  - r-leaflet
  - r-rgdal
  - r-shinydashboard
  - r-shinywidgets
  - r-shinycssloaders
  - r-igraph

可以与

conda env create -n so-igraph -f so-igraph.yaml
conda activate so-igraph

Answer 2

我对AlmaLinux上的R也有类似的问题，结果发现我错过了操作系统本身上的一些库，我认为这是我拥有的，而且对于一些R包来说是必要的。我认为它们是这些，这是有意义的，考虑到我们谈论的是graphing，一个绘图包：

gsl-devel-2.5-1.el8.x86_64                     
gsl-2.5-1.el8.x86_64
openssl-1.1.1k-6.el8_5.x86_64
geos-devel-3.7.2-1.el8.x86_64                  
geos-3.7.2-1.el8.x86_64
proj-datumgrid-1.8-6.3.2.4.el8.noarch         
proj-6.3.2-4.el8.x86_64
libtiff-devel-4.0.9-21.el8.x86_64             
libgeotiff-devel-1.5.1-1.el8.x86_64           
libgeotiff-1.5.1-1.el8.x86_64

Answer 3

安装openblas可能有效，请参阅https://github.com/conda-forge/r-igraph-feedstock/issues/19