是否有相当于pip的‘--root`’path选项的conda (mamba)？

Question

背景

我有一个用于JupyterLab图像的多级Dockerfile。有三个阶段：

• server
• kernel：mamba create -y -n /tmp/kernel-packages/myenv ...
• runner

FROM ... as runner
...

COPY --from=kernel /tmp/kernel-packages/ /opt/conda/envs
RUN conda config --append envs_dirs /opt/conda/envs/

...

问题

在生成的映像中，首选 python -m pip工作，但pip提供：

bash: /opt/conda/envs/myenv/bin/pip: /tmp/kernel-packages/myenv/bin/python3.9: bad interpreter: No such file or directory

原因是pip把#!/tmp/kernel-packages/myenv/bin/python3.9作为它的支撑点。

期望的

一种类似于pip install --root /tmp/server-packages ...的行为，它在COPY --from=server /tmp/server-packages /中非常好地工作。

更多信息

此外，一些其他二进制文件，如curl或papermill，也有由conda硬编码的错误路径。我读过关于Anaconda ?移动Conda环境的文章，但是使用conda-pack和conda-unpack似乎太过分了。

解决办法

只需按名称创建一个env：mamba create -y -n myenv，然后在runner阶段创建COPY --from=kernel /opt/conda/envs /opt/conda/envs。

问题

有一个Conda (Mamba)等价于pip install**'s** --root 选项吗？--我并不是在寻找所述问题的解决方案，因为我已经找到了一种适合我自己的方法。我感兴趣的纯粹是conda二进制的功能。

Answer 1

--prefix参数是等价的--只是一些Conda包使用硬编码路径，因此遇到了问题。

conda-prefix-replacement

要通过复制操作正确地将Conda环境移动到新前缀，需要运行conda-prefix-replacement工具(a.k.a.，cpr)，以确保所有具有硬编码路径的文件都被更新到新位置。想必，conda-pack也在做一件类似的事情，只是一时半途而废.

出于您的目的，您可以考虑在内核映像中的环境上预先运行cpr，以便它们可以在部署的位置工作。尽管这意味着总是COPYing到相同的位置。

有关使用的详细信息，请参阅存储库。