我如何在熊猫中重命名类别，使某些类别被合并？

Question

我有一个淋巴结AnnData集，它有各种各样的，有时是非描述性和高度特异性的细胞类型：

lymph_data.obs.cell_type = lymph_data.obs.cell_type.cat.rename_categories(
    {'B_mem': 'memory B cell', 
    'B_naive': 'naive B cell', 
    'T_CD4+_naive': 'naive CD4+ T cell', 
    'B_Cycling': 'cycling B cell', 
    'T_CD4+_TfH': 'TfH CD4+ T cell', 
    'T_CD8+_cytotoxic': 'cytotoxic CD8+ T cell', 
    'T_CD4+_TfH_GC': 'TfH CD4+ Germinal Center T cell', 
    'B_GC_LZ': 'Light Zone Germinal Center B cell', 
    'T_CD4+': 'CD 4+ T cell', 
    'T_Treg': 'Treg T cell',
    'B_GC_DZ': 'Dark Zone Germinal Center B cell',
    'T_CD8+_CD161+': 'CD8+ CD161+ T cell',
    'T_CD8+_naive': 'CD8+ naive T cell',
    'NK': 'natural killer cell',
    'B_activated,0': 'activated B cell 0',
    'B_plasma': 'plasma B cell',
    'T_TfR': 'TfR T cell',
    'B_activated,1': 'activated B cell 1',
    'NKT': 'natural killer T cell',
    'B_activated,2': 'activated B cell 2',
    'B_activated,3': 'activated B cell 3',
    'Endo': 'endothelial cell',
    'ILC': 'Innate lymphoid cell',
    'B_activated,4': 'activated B cell 4',
    'T_TIM3+': 'TIM3+ T cell',
    'Monocytes': 'monocyte',
    'DC_pDC': 'pDC',
    'B_IFN': 'Interferon B cell',
    'DC_cDC2': 'cDC2',
    'Macrophages_M1': 'M1 macrophage',
    'Macrophages_M2': 'M2 macrophage',
    'DC_cDC1': 'cDC1',
    'FDC': 'Follicular DC',
    'B_GC_prePB': 'prePB B cell',
    'DC_CCR7+': 'DC_CCR7+',
    'VSMC': 'VSMC',
    'Masth': 'mast cell'})

我想将其中一些单元格类型合并到相同的类别中，例如，activated B cell 0-5。然而，rename_categories要求类别名称保持惟一，使用loc来子集和重新分配值是不雅观的，并且在我试图调用rename_categories时也给了我一个类似的问题。我觉得用R's的tidyverse很容易，但是我对熊猫来说还是新手，我似乎找不到一个好的方法来做这个。谢谢!

Answer 1

lymph_data.obs.cell_type.replace(..)