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社区首页 >问答首页 >部署在R4.0.3上的闪亮应用程序失败，但在4.1.2 (包依赖项)上有效

问部署在R4.0.3上的闪亮应用程序失败，但在4.1.2 (包依赖项)上有效
EN

Stack Overflow用户
提问于 2022-02-18 20:44:21
回答 2查看 284关注 0票数 0

我有一个应用程序在本地运行ok R4.1.2，当我在服务器R4.0.3上部署时，它在呈现datatable的一个非常特定的点上失败。

我有其他的数据在同一个应用程序，工作和渲染罚款。

我得到的错误非常大，在构建和安装软件包时已经出现了服务器时间。

生成码头容器时出现的Vage错误：

代码语言：javascript
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...
g++ -std=gnu++11 -shared -L/opt/ownr/R/lib/R/lib -L/usr/local/lib -o dplyr.so chop.o filter.o funs.o group_by.o group_data.o imports.o init.o mask.o mutate.o slice.o summarise.o -L/opt/ownr/R/lib/R/lib -lR
installing to /opt/ownr/R/lib/R/library/00LOCK-dplyr/00new/dplyr/libs
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error : 'format_warning' is not an exported object from 'namespace:cli'
Warning: replacing previous import ‘ellipsis::check_dots_unnamed’ by ‘rlang::check_dots_unnamed’ when loading ‘pillar’
Warning: replacing previous import ‘ellipsis::check_dots_used’ by ‘rlang::check_dots_used’ when loading ‘pillar’
Warning: replacing previous import ‘ellipsis::check_dots_empty’ by ‘rlang::check_dots_empty’ when loading ‘pillar’
Warning: replacing previous import ‘ellipsis::check_dots_unnamed’ by ‘rlang::check_dots_unnamed’ when loading ‘tibble’
Warning: replacing previous import ‘ellipsis::check_dots_used’ by ‘rlang::check_dots_used’ when loading ‘tibble’
Warning: replacing previous import ‘ellipsis::check_dots_empty’ by ‘rlang::check_dots_empty’ when loading ‘tibble’

然后，当我实际运行应用程序时，会出现相同的错误。

代码语言：javascript
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Successfully fetched  6  tracks in  15.351  seconds
Warning: Error in : 'format_message' is not an exported object from 'namespace:cli'
  121: %>%
  120: <reactive:session$userData$tracks.per.ranger.per.month> [/opt/ownr/app/server.R#292]
  104: session$userData$tracks.per.ranger.per.month
  103: exprFunc [/opt/ownr/app/server.R#344]
  102: widgetFunc
  101: htmlwidgets::shinyRenderWidget
  100: func
   87: renderFunc
   86: renderFunc
   82: renderFunc
   81: output$tableRanger
    1: runApp

生成错误的代码：

代码语言：javascript
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  # per ranger per month
  session$userData$tracks.per.ranger.per.month <- reactive({
    req(session$userData$tracksdata())
    df.table <- session$userData$tracksdata()
    df.table$month <- floor_date(as_date(df.table$startWhen), "month")
    df.table$ranger <- as.factor(df.table$agentName)
    
    df <- df.table %>%   ### <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<--------------          line 292
      dplyr::rename(duration=patrolDuration) %>%
      dplyr::select('featureType','month','duration','ranger','length') %>%
      dplyr::group_by(ranger,month) %>%
      dplyr::summarize(patrols=n(),
                       duration = sum(duration),
                       length = sum(length))
    # dplyr::mutate(
    #   avgLength = round(length/numberOfpatrols,0),
    #   avgSpeed = round(length/patrolDuration,0)
    #   )
    
    df
  })

我试着降低dplyr的评级，或者不择手段，但没有运气。

我被困住了，别无选择.

请指点！

=============================附加细节=============================

局部sessionInfo()

代码语言：javascript
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─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
 setting  value                       
 version  R version 4.1.2 (2021-11-01)
 os       Ubuntu 18.04.6 LTS          
 system   x86_64, linux-gnu           
 ui       RStudio                     
 language (EN)                        
 collate  en_US.UTF-8                 
 ctype    en_US.UTF-8                 
 tz       Europe/Amsterdam            
 date     2022-02-18                  

─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
 package      * version  date       lib source        
 assertthat     0.2.1    2019-03-21 [1] CRAN (R 4.1.2)
 bslib          0.2.5.1  2021-05-18 [1] CRAN (R 4.1.0)
 cachem         1.0.5    2021-05-15 [1] CRAN (R 4.1.0)
 Cairo          1.5-12.2 2020-07-07 [1] CRAN (R 4.1.2)
 cli            3.1.0    2021-10-27 [1] CRAN (R 4.1.2)
 colorRamps   * 2.3      2012-10-29 [1] CRAN (R 4.1.1)
 colorspace     2.0-1    2021-05-04 [1] CRAN (R 4.1.0)
 crayon         1.4.1    2021-02-08 [1] CRAN (R 4.1.0)
 crosstalk      1.1.1    2021-01-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
 curl           4.3.1    2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)
 data.table     1.14.0   2021-02-21 [1] CRAN (R 4.1.0)
 data.tree    * 1.0.0    2020-08-03 [1] CRAN (R 4.1.0)
 DBI            1.1.1    2021-01-15 [1] CRAN (R 4.1.1)
 digest         0.6.27   2020-10-24 [1] CRAN (R 4.1.0)
 dplyr        * 1.0.8    2022-02-08 [1] CRAN (R 4.1.2)
 DT           * 0.18     2021-04-14 [1] CRAN (R 4.1.0)
 ellipsis       0.3.2    2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)
 fansi          0.5.0    2021-05-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
 farver         2.1.0    2021-02-28 [1] CRAN (R 4.1.0)
 fastmap        1.1.0    2021-01-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
 generics       0.1.2    2022-01-31 [1] CRAN (R 4.1.2)
 geojsonR       1.1.0    2021-05-04 [1] CRAN (R 4.1.1)
 ggplot2      * 3.3.5    2021-06-25 [1] CRAN (R 4.1.2)
 glue           1.4.2    2020-08-27 [1] CRAN (R 4.1.0)
 gtable         0.3.0    2019-03-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
 htmltools      0.5.1.1  2021-01-22 [1] CRAN (R 4.1.0)
 htmlwidgets    1.5.3    2020-12-10 [1] CRAN (R 4.1.0)
 httpuv         1.6.1    2021-05-07 [1] CRAN (R 4.1.0)
 httr         * 1.4.2    2020-07-20 [1] CRAN (R 4.1.0)
 jquerylib      0.1.4    2021-04-26 [1] CRAN (R 4.1.0)
 jsonlite     * 1.7.2    2020-12-09 [1] CRAN (R 4.1.0)
 labeling       0.4.2    2020-10-20 [1] CRAN (R 4.1.0)
 later          1.2.0    2021-04-23 [1] CRAN (R 4.1.0)
 lazyeval       0.2.2    2019-03-15 [1] CRAN (R 4.1.0)
 lifecycle      1.0.1    2021-09-24 [1] CRAN (R 4.1.2)
 loggit       * 2.1.1    2021-02-28 [1] CRAN (R 4.1.0)
 lubridate    * 1.7.10   2021-02-26 [1] CRAN (R 4.1.0)
 magrittr       2.0.1    2020-11-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
 mime           0.10     2021-02-13 [1] CRAN (R 4.1.0)
 munsell        0.5.0    2018-06-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
 pillar         1.6.1    2021-05-16 [1] CRAN (R 4.1.0)
 pkgconfig      2.0.3    2019-09-22 [1] CRAN (R 4.1.0)
 plotly       * 4.9.3    2021-01-10 [1] CRAN (R 4.1.0)
 promises       1.2.0.1  2021-02-11 [1] CRAN (R 4.1.0)
 purrr          0.3.4    2020-04-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
 R6             2.5.0    2020-10-28 [1] CRAN (R 4.1.0)
 RColorBrewer * 1.1-2    2014-12-07 [1] CRAN (R 4.1.0)
 Rcpp           1.0.7    2021-07-07 [1] CRAN (R 4.1.2)
 rlang          1.0.1    2022-02-03 [1] CRAN (R 4.1.2)
 rlist        * 0.4.6.1  2016-04-04 [1] CRAN (R 4.1.0)
 rsconnect      0.8.25   2021-11-19 [1] CRAN (R 4.1.2)
 rstudioapi     0.13     2020-11-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
 sass           0.4.0    2021-05-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
 scales         1.1.1    2020-05-11 [1] CRAN (R 4.1.0)
 sessioninfo    1.1.1    2018-11-05 [1] CRAN (R 4.1.0)
 shiny        * 1.6.0    2021-01-25 [1] CRAN (R 4.1.0)
 shinyjs      * 2.1.0    2021-12-23 [1] CRAN (R 4.1.2)
 stringi        1.6.2    2021-05-17 [1] CRAN (R 4.1.0)
 tibble         3.1.2    2021-05-16 [1] CRAN (R 4.1.0)
 tidyr          1.2.0    2022-02-01 [1] CRAN (R 4.1.2)
 tidyselect     1.1.1    2021-04-30 [1] CRAN (R 4.1.0)
 utf8           1.2.1    2021-03-12 [1] CRAN (R 4.1.0)
 vctrs          0.3.8    2021-04-29 [1] CRAN (R 4.1.0)
 viridisLite    0.4.0    2021-04-13 [1] CRAN (R 4.1.2)
 withr          2.4.2    2021-04-18 [1] CRAN (R 4.1.0)
 xtable         1.8-4    2019-04-21 [1] CRAN (R 4.1.0)
 yaml           2.2.1    2020-02-01 [1] CRAN (R 4.1.0)

在服务器上，我只能使用R4.0.3 sessionInfo()

代码语言：javascript
复制
─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
 setting  value                       
 version  R version 4.0.3 (2020-10-10)
 os       Ubuntu 20.04.1 LTS          
 system   x86_64, linux-gnu           
 ui       X11                         
 language (EN)                        
 collate  en_US.UTF-8                 
 ctype    en_US.UTF-8                 
 tz       Etc/UTC                     
 date     2022-02-18                  ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
 package      * version date       lib source        
 bslib          0.2.4   2021-01-25 [1] CRAN (R 4.0.3)
 cachem         1.0.4   2021-02-13 [1] CRAN (R 4.0.3)
 cli            2.4.0   2021-04-05 [1] CRAN (R 4.0.3)
 colorRamps   * 2.3     2012-10-29 [1] CRAN (R 4.0.3)
 colorspace     2.0-2   2021-06-24 [1] CRAN (R 4.0.3)
 crayon         1.4.1   2021-02-08 [1] CRAN (R 4.0.3)
 crosstalk      1.1.1   2021-01-12 [1] CRAN (R 4.0.3)
 data.table     1.14.2  2021-09-27 [1] CRAN (R 4.0.3)
 digest         0.6.27  2020-10-24 [1] CRAN (R 4.0.3)
 dplyr        * 1.0.8   2022-02-08 [1] CRAN (R 4.0.3)
 DT           * 0.17    2021-01-06 [1] CRAN (R 4.0.3)
 ellipsis       0.3.1   2020-05-15 [1] CRAN (R 4.0.3)
 fansi          0.4.2   2021-01-15 [1] CRAN (R 4.0.3)
 fastmap        1.1.0   2021-01-25 [1] CRAN (R 4.0.3)
 generics       0.1.2   2022-01-31 [1] CRAN (R 4.0.3)
 ggplot2      * 3.3.5   2021-06-25 [1] CRAN (R 4.0.3)
 glue           1.4.2   2020-08-27 [1] CRAN (R 4.0.3)
 gtable         0.3.0   2019-03-25 [1] CRAN (R 4.0.3)
 htmltools      0.5.1.1 2021-01-22 [1] CRAN (R 4.0.3)
 htmlwidgets    1.5.3   2020-12-10 [1] CRAN (R 4.0.3)
 httpuv         1.5.5   2021-01-13 [1] CRAN (R 4.0.3)
 httr         * 1.4.2   2020-07-20 [1] CRAN (R 4.0.3)
 jquerylib      0.1.3   2020-12-17 [1] CRAN (R 4.0.3)
 jsonlite     * 1.7.2   2020-12-09 [1] CRAN (R 4.0.3)
 later          1.1.0.1 2020-06-05 [1] CRAN (R 4.0.3)
 lazyeval       0.2.2   2019-03-15 [1] CRAN (R 4.0.3)
 lifecycle      1.0.1   2021-09-24 [1] CRAN (R 4.0.3)
 loggit       * 2.1.1   2021-02-28 [1] CRAN (R 4.0.3)
 lubridate    * 1.8.0   2021-10-07 [1] CRAN (R 4.0.3)
 magrittr       2.0.1   2020-11-17 [1] CRAN (R 4.0.3)
 mime           0.10    2021-02-13 [1] CRAN (R 4.0.3)
 munsell        0.5.0   2018-06-12 [1] CRAN (R 4.0.3)
 pillar         1.5.1   2021-03-05 [1] CRAN (R 4.0.3)
 pkgconfig      2.0.3   2019-09-22 [1] CRAN (R 4.0.3)
 plotly       * 4.10.0  2021-10-09 [1] CRAN (R 4.0.3)
 promises       1.2.0.1 2021-02-11 [1] CRAN (R 4.0.3)
 purrr          0.3.4   2020-04-17 [1] CRAN (R 4.0.3)
 R6             2.5.0   2020-10-28 [1] CRAN (R 4.0.3)
 RColorBrewer * 1.1-2   2014-12-07 [1] CRAN (R 4.0.3)
 Rcpp           1.0.6   2021-01-15 [1] CRAN (R 4.0.3)
 rlang          1.0.1   2022-02-03 [1] CRAN (R 4.0.3)
 sass           0.3.1   2021-01-24 [1] CRAN (R 4.0.3)
 scales         1.1.1   2020-05-11 [1] CRAN (R 4.0.3)
 sessioninfo    1.1.1   2018-11-05 [1] CRAN (R 4.0.3)
 shiny        * 1.6.0   2021-01-25 [1] CRAN (R 4.0.3)
 shinyjs      * 2.1.0   2021-12-23 [1] CRAN (R 4.0.3)
 tibble         3.1.0   2021-02-25 [1] CRAN (R 4.0.3)
 tidyr          1.2.0   2022-02-01 [1] CRAN (R 4.0.3)
 tidyselect     1.1.1   2021-04-30 [1] CRAN (R 4.0.3)
 utf8           1.2.1   2021-03-12 [1] CRAN (R 4.0.3)
 vctrs          0.3.7   2021-03-29 [1] CRAN (R 4.0.3)
 viridisLite    0.4.0   2021-04-13 [1] CRAN (R 4.0.3)
 withr          2.4.1   2021-01-26 [1] CRAN (R 4.0.3)
 xtable         1.8-4   2019-04-21 [1] CRAN (R 4.0.3)
 yaml           2.2.1   2020-02-01 [1] CRAN (R 4.0.3)
r
dplyr
shiny
datatable
r-plotly
EN

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-02-20 17:26:34

这似乎是一个依赖版本问题--您使用的新dplyr (1.0.8)在4.0和4.1上使用了不同的cli版本。错误在于dplyr不应该接受旧版本的cli，但这是您无法控制的。

您可以做的是尝试安装一个较旧版本的dplyr，一个与cli软件包2.4.0版本一起工作的版本。最简单的方法是从github安装较早版本的dplyr。

票数 0
EN

Stack Overflow用户

发布于 2022-02-22 14:01:57

我相当肯定，您只需要更新R4.0.3服务器上的cli。服务器上有cli 2.4.0，它没有format_warning()或format_message()。在本地，您有cli 3.1.0，它具有这两个函数。所以，只要更新服务器上的cli版本，它就会再次工作。

票数 1
EN
页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/71179648

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