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社区首页 >问答首页 >是否有一个R函数将'flowFrame‘结构的'flowCore’包转换为‘data.framework’?

是否有一个R函数将'flowFrame‘结构的'flowCore’包转换为‘data.framework’?
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Stack Overflow用户
提问于 2022-02-03 04:46:46
回答 1查看 226关注 0票数 1

目的:利用R语言将.fcs数据视为数据。

流式细胞术数据以.fcs文件格式提供。该文件在flowFrame结构生成器中使用flowCore包的read函数读取。我想在R中阅读它,如何将它转换成data.frame结构?

有关资料如下:

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-02-03 06:49:46

使用exprs包的__函数。虽然它的文档没有清楚地说明这个用例,但它对我起了作用。

代码语言:javascript
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df = fcs@exprs

哪里,

代码语言:javascript
复制
fcs  =read.FCS("File_lcoation", truncate_max_range = FALSE)

要求:-

  1. flowCore (read.FCS)-Code: 如果(!require("BiocManager",静默= TRUE)) install.packages("BiocManager") 生物管理器::安装(“flowCore”)
  2. MetaCyto (exprs)-Code: if (!require("BiocManager",BiocManager= TRUE)) install.packages("BiocManager") 生物管理器::安装(“MetaCyto”)
票数 1
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/70966065

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