重订传说

Question

我做了一个回归，看起来是这样的：

survfit(Surv(YearsToEvent, Event) ~ CancerType, data = RegressionData)

由此，我得到了这样一个输出表(为了提高可读性，我删除了一些列)：

          n 
Cancer A  100  
Cancer B  200  

但是，当我使用ggsurvplot绘制输出时，其中有一个plot +一个带有"number at risk“的表，我希望能够手动调整图例的顺序。也就是说，我希望能够将Cancer B放在Cancer A之前。我在这里发现了一个类似的线程：How to reorder strata in survfit object for ggsurvplot legend?。但是，我没有在里面找到任何答案。我试图在回归之前对数据框架RegressionData进行排序，但没有成功。

有人能帮我一下吗？

Answer 1

下面是一个如何实现您想要的目标的例子：

主要步骤是将分组变量转换为因子类。然后，您可以手动定义级别：

其他步骤是相同的：

library(survminer)
library(survival)
library(tidyverse)

lung1 <- lung %>% 
  mutate(sex = factor(sex, levels = c(2, 1)))
  
ggsurvplot(
  fit = survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung1),
  risk.table = TRUE,
  xlab = "Days", 
  ylab = "Overall survival probability")

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