用每个键的多个值绘制字典的最佳方法？

Question

我需要创建一个DNA序列ID和分子量字典的散点图。许多DNA序列是模棱两可的，因此它们可能有许多可能的分子量(因此每个键有许多值)。字典看起来是这样的，但是许多键实际上有更多的值(为了简洁起见，我删除了一些)。

{'seq_7009': [6236.9764, 6279.027699999999,
   6319.051799999999, 6367.049999999999],
 'seq_418': [3716.3642000000004, 3796.4124000000006],
 'seq_9143_unamb': [4631.958999999999],
 'seq_2888': [5219.3359, 5365.4089],
 'seq_1101': [4287.7417, 4422.8254]}

我有一个叫做get_all_weights的函数，它生成这个字典，所以我尝试调用这个函数，然后绘制结果。到目前为止，这是我在这个网站上的另一篇文章的基础上得到的，但是它不起作用：

import matplotlib.pyplot as plt
import itertools

def graph_weights(file_name):
    with open (file_name) as file:
        d = {} # Initialize a dictionary and then fill it with the results of the get_all_weights function
        d.update(get_all_weights(file_name))  
        for k, v in d.items():
            x = [key for (key,values) in b.items() for _ in range(len(values))]
            y = [val for subl in d.values() for val in subl]
            ax.plot(x, y)
    plt.show()

有人知道我是怎么做到的吗？图中应该显示x轴上的序列it和y轴上的值，并且应该清楚地表明相同的值可以多次发生。

Answer 1

和它应该清楚地表明，相同的值可以多次发生。

对于默认的matplotlib图，这一点并不清楚，因为类似/相同的点将直接重叠。

虽然manually add jittering是可能的，但最简单的方法是使用海运的swarmplot或stripplot。

1. 创建一个dataframe from_dict：

进口熊猫为pd数据= pd.DataFrame.from_dict(d，东方=‘指数’(.T# seq_7009 seq_418 seq_9143_unamb seq_2888 seq_1101 #0 6236.9764 3716.3642 4631.959 5219.3359 4287.7417 #1 6279.0277 NaN 5365.4089 4422.8254 # 6319.0518 NaN #3 6367.0500 NaN )

然后，

1. 使用swarmplot或stripplot：

以sns sns.swarmplot(data=data)的形式导入海运

进口海运为sns sns.stripplot(data=data)